美国时间 6 月 2 日上午，在沃尔特华盛顿会议中心举办的美国消化疾病周（DDW2018）上，美国胃肠病学会（AGA）组织了胃肠道微生物群和微生物疾病的杰出摘要全体会议。来自香港大学深圳研究院消化内科及药物治疗所的 Olabisi Oluwabukola Coker，在会上分享了他们团队关于肠道真菌组成及菌群失调与结直肠癌的关系的最新研究成果。
结直肠癌通常与肠道菌群失调密切相关，那么真菌的菌群失调是否参与其中？
众所周知，肠道菌群失调与包括结直肠癌（CRC）在内的肠胃疾病有关。虽然肠道细菌的变化在 CRC 中已被广泛研究，但对真菌微生物群的研究尚不充分。这项研究的目的在于探索与 CRC 相关的真菌群落。
在早期和晚期 CRC 中，观察到由不同的真菌群落构成的 CRC 阶段特异性菌群失调
研究团队收集了来自香港 74 例 CRC 患者和 92 例对照者的粪便，采用鸟枪法宏基因组测序，通过测序所得的 K-mer 图与最低祖先的基因组数据图谱比对，进行分类。校正年龄、性别、BMI 因素后，采用多元线性回归模型分析真菌特性和疾病表型之间的关系。采用 SparCC 和 Spearman 相关系数分析肠道内真菌和细菌的相互作用。以来自德国和法国的 90 例 CRC 患者和 66 例对照者对实验结果进行验证。
在 CRC 患者和对照组中，主要的真菌微生物群是子囊菌和担子菌。然而，在 CRC 患者中，担子菌与子囊菌的比例较高 (P = 0.0042)，同时存在马拉色菌增多 (P<0.0001)，酵母菌 (P<0.0001) 和肺孢子菌减少 (P = 0.0017) 的现象。主成分分析（PCA）结果显示 CRC 组的肠道真菌组成和对照组显著不同（P<0.0001）。
有趣的是，在早期和晚期 CRC（PCA，P = 0.0048）中，观察到由不同的真菌群落构成的 CRC 阶段特异性菌群失调。13 个真菌种群的不同，造就了 CRC 组与对照组的显著差异，实验组和验证组中的受试者工作特性曲线下面积（AUCs）分别为 0.85 和 0.77；以实验组 AUCs 0.83 和验证组 AUCs 0.76 为节点，可以诊断早期的 CRC。
进一步的生态分析显示，与对照组相比，CRC 组中出现更多有共存关系的真菌 (P<0.0001)，伴随一些新的共生菌群的出现，包括 Thieloviopsis、Moniliopthora 和马拉色菌属。然而，与对照组相比，CRC 组中真菌和细菌的关系，更多的是排斥，主要体现在真菌子囊菌和细菌变形杆菌之间呈负相关，提示在 CRC 中真菌和细菌的拮抗关系。
肠道真菌组成及菌群失调与结直肠癌关系密切
本次研究证实，在 CRC 患者中存在相关的真菌群落失调，其特征是真菌菌落组成的改变，以及不均衡的内部和外部生态网络。这意味着除了细菌外，肠道真菌微生物群可能确实在结直肠癌的发生发展过程中起着作用。