为帮助各领域广大科研人员解决从方案设计、数据解读、图表绘制、数据挖掘和文章设计各环节中遇到的问题。北京市计算中心特聘请XX一线项目经验丰富的科研人员精心组织了本次培训课程,为保证听课质量和教学质量,本研讨班采用小班授课方式。课程内容针对性极强、上机实践比重更达到70%,整套课程教学目的明确,从微生物组学实验方案的宏观到细节再到注意事项的讲解,为项目能产出更有效的测序数据打下坚实的基础,上机实践课程贯穿从测序数据下机后质量评估、物种注释到数据分析和结果呈现整个流程。诚邀各领域广大科研工作者和高校教师及研究生报名参加!
主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:北京市计算中心
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
北京微生太科技有限公司
北京依托华茂生物科技有限公司
培训地点:北京海淀区丰贤中路7号3号楼,北京市计算中心三层会议室
培训时间:2018年7月26日-29日(报名中) 上午:9:00 - 12:00 下午:1:30 – 5:00
日期 | 上课时间 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 9:30-12:00 | 微生物组学研究概论及进展 | 1、微生物组研究的发展历史 2、微生物测序分析技术及实验技术原理 3、研究热点分享 |
13:30-17:30 | 经典案例分享和方案设计与文章架构设计 | 1、微生物组学经典文章回顾,未来微生物组学发展方向 2、已发表各类精品文章的经验总结:包括经典项目总体设计思路、遇到的困难及解决方案 3、文章写作经验分享,包括文章架构设计、语言风格、结果呈现等写作技巧 | |
第二天 | 9:00-12:00 | Linux基础操作 | 1、Linux常用命令使用和上机操作 2、Linux环境下软件安装 |
16s测序分析结果解读 | 1、OUT分析 2、物种分类与丰度分析 3、Alpha多样性分析 4、Beta多样性分析 5、显著性差异分析 | ||
13:30-17:30 | 16s数据分析 (上机) | 1、质控与数据拼接 2、OTU聚类 3、物种注释 4、统计分析:(1)α多样性分析;(2)β多样性分析;(3)群落结构及丰度分析;(4)进化分析;(5)差异分析(Lefse);(6)功能分析(picrust)。 | |
第三天 | 9:00-12:00 | 宏基因组测序分析结果解读 | 1、物种注释分析 2、差异物种分析 3、差异基因分析 4、功能注释分析 5、MGS分析 |
13:30-17:30 | 宏基因组数据分析(上机) | 1、质控 2、拼接组装 3、聚类Binning:TETRA; MetaCluster; Phymm等 4、基因注释:FragGeneScan;MetaGeneMark;MetaGeneAnnotator等 5、功能注释:RAMMCAP;Blast等 6、统计分析:(1)物种分析;(2)功能分析;(3)差异分析;(4)比较分析 | |
第四天 | 9:00-12:00 | R的数据处理功能及统计应用 | 1、R的安装、运行与使用 2、R语法介绍(R基本符号) 3、R数据处理,对R语言中常用的数据结构包括向量,数组,矩阵,列表,数据框等的介绍、使用方法及使用范围 |
13:30-17:30 | R绘图功能在微生物组学信息分析中的应用 | 1、基础绘图工具(绘图函数、参数、画图面板分割及图形的保存) 2、微生物组学数据结果制作案例实际操作
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(课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
【讲师团队】
邀请中科院、北大、军科院和北京市计算中心一线工作经验丰富的老师主讲。
【报名费用】培训费:5200元/人(材料费、上机费、午餐费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。
附近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,费用自理。
【联系咨询】QQ号:3498448850 , 张老师 18618295767, 邮箱:bcc_peixun@163.com