perl语言零基础培训班

作者:   2013-09-03
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  • 会议时间: 2013-09-15至 2013-09-18
  • 会议地点: 北京
  • 电话:010-59341771
  • 传真:
  • 联系人:张利英
  • Email: zhangly@bcc.ac.cn
  • 联系地址:北京市海淀区永丰产业基地丰贤中路7号
  • 会议网址:www.bioc.org.cn/China/

Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选语言之一。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生物学、医学、农学等人员,且有从事生物信息学工作相关研究工作的需要。欢迎您报名参加!


主办单位:北京市计算中心,生物计算事业部
举办地:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
培训时间2013年9月15日-18日  
报名截止:2013年 9月18日
培训内容及安排: 

 


日期

时间

授课题目

授课内容

第一天

09:30-10:00

生物信息学与Perl语言概述

概括介绍生物信息学背景与Perl语言的概念及特点

10:00-10:20

软件安装与运行环境调试

Perl语言解释器、编辑器安装,Perl程序运行测试

10:20-12:00

基本操作与基本概念

DOS、Unix命令行操作基本命令;Perl语言基本变量与操作符

13:30-16:00

基本变量

变量、字符串赋值、基本运算等练习

第二天

09:30-12:00

基本语法结构

判断结构;循环结构;练习

13:30-16:00

数组及应用

数组的概念及用法;练习

第三天

09:30-11:00

文件与文件夹操作

文件的读入与输入;文件夹操作;练习

11:00-12:00

二维数组与hash表及应用

二维数组概念、关联数组(hash表)概念及用法;练习

13:30-16:00

常用函数及子程序

常用Perl语言基础函数学习;子程序概念与应用;练习

第四天

09:30-12:00

正则表达式及生物信息学Perl程序实例

Perl特色功能正则表达式学习与应用;生物信息学实例程序学习;练习

13:30-16:00

Bioperl简介、CPAN简介、常用生物信息学数据库与软件简介

Bioperl简介与安装;Perl第三方代码库CPAN简介;常用生物信息学数据库简介、数据类型与应用;常用生物信息学软件数据格式及软件应用简介

授课实例

1、生物学数据文件批量的合并、分隔、去冗余等。
2、生物信息序列数据fastq、fasta、genbank文件等格式转换与批量自动化处理。
3、按个性化实验需求,从生物信息学数据库文件(如genbank、EMBL)中批量自动化提取特定数据信息。
4、表格矩阵型数据的行列转换、特定数据信息的自动化过滤与数据筛选等。
5、二代测序原始数据的批量过滤处理,如barcode识别、质量值过滤等。
6、基因、蛋白质序列特定位点的识别,如起始、终止位点、ORF、motif、CDS等。
7、生物信息学数据序列特征提取与自动化统计,如GC百分含量、k-mer统计、基因反向互补转换等。
8、生物信息学数据库文件的批量自动化下载与信息提取(选学)。

(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)


培训特色
1、对口生物信息;    2、非严格语法,适合初学;
3、功能强大、跨平台;4、有巨大的第三方代码库CPAN

报名费用注册费:2800元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。
付费方式现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937 
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”)
报名优惠政策
1、开课前20天报名的学员每人可减少200元;
2、3人以上团体报名的学员每人可减少200元;
3、任意两班同时报名可减少300元;
4、4+1团报,可免费赠送一个名额                
5、4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种
联系咨询
张利英 010-59341771 ,18618295767,QQ号:2814500767,邮箱:zhangly@bcc.ac.cn
员丽丽 010-59341773, 18701529461 ,  邮箱:yuanll@bcc.ac.cn

 

报名回执表:


培训班类型:(可多选)

□实用生物信息学培训班  □论文发表所需的图表处理实用技能
□生物信息与宏基因组分析专题研讨班    □Perl语言专题班
□实用生物信息技术及应用(罗静初教授主讲)

姓名:

 

性别

 

民族:

 

职称:

 

身份证号

 

工作单位:

 

住宿:

是□;否□

研究方向:

 

报名时间:

 

通讯地址:

 

邮编:

 

固定电话:

 

手机

 

E-mail:

 

报名种类:

A□           B□           (该选项仅报名生物信息培训班人员填写)

对课程了解情况

☆☆☆☆☆

感兴趣的课程:

 

信息渠道:

□中心主页 □邮件宣传(张利英、员丽丽)□海报 □单页 □销售员  □丁香园  □生物论坛  □生物通邮件、主页  □朋友推荐               

发票抬头:

 

发票内容:

 

住宿明细

入住时间:
离店时间:

房间类型

□大床间
□标准间(和       合住)
□拼房(与其他学员拼标准间)

备注:

 

确定报名后,请将回执表发到上述联系人邮箱里。如在两日内没有收到回复,请电话联系确认。

编辑: 小林   

声明:

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