高通量芯片及测序技术的快速发展和应用积累了海量的生物学数据，多个数据库诸如GEO、TCGA、ArrayExpress等被建立用来存储、查询以及分析挖掘有意义的生物信息。这些数据库具有免费、公开、操作界面友好的特点，几乎覆盖了所有器官、组织、细胞相关的基因组、转录组、表观组、蛋白质组等数据。了解这些数据库，掌握数据挖掘的相关技巧将有助于我们快速寻找靠谱的研究靶点，提高科研的质量和效率，发表高质量的SCI论文，奠定基金申请所需的前期工作基础等。
培训时间：2019年6月22-23日 (6月21日签到）
培训地点：上海市长宁区福泉北路518号IBP二期2座
课程内容
| 时间安排 | 课程内容 | 介绍 | |
| 2019年6月22日 | |||
| 09:00-10:20 | 生物数据挖掘与科研 | 生物数据挖掘概述 常规高通量检测技术介绍 | 了解掌握生物大数据挖掘的背景知识 |
| 10:40-12:00 | 常用数据库 | 基因综合数据库NCBI 基因表达数据库GEO | 掌握生物数据解读、查找和存储的能力 |
| 13:30-15:00 | 差异表达分析 | 方法介绍 软件实现 GEO2R工具 差异基因可视化 热图绘制 | 无需编程，快速实现差异基因表达分析和可视化，掌握绘制热图的常规软件 |
| 15:20-17:00 | 功能富集分析 | 基本原理介绍 GO与KEGG数据库 富集分析常用软件介绍 功能富集分析结果可视化及解读 | 掌握GO、KEGG、DAVID等数据库的使用 |
| 2019年6月23日 | |||
| 09:00-10:20 | 基因/蛋白互作分析 | 基因/蛋白互作数据库介绍 Cytoscape软件介绍与操作 网络拓扑性质分析 常用插件使用 | 熟练运用Cytoscape绘制高质量的基因/蛋白互作网络图，并掌握利用网络拓扑性质实现关键靶点的挖掘策略 |
| 10:40-12:00 | 数据挖掘相关SCI文章解析 | 研究靶点挖掘策略 经典SCI文章套路解析 | 经典文章解析进一步理解数据挖掘的相关思路 |
| 13:30-16:00 | 实操 | 基因和蛋白基本信息查找 Blast序列比对 Primer-BLAST PCR引物设计 GEO数据库查找 GEO2R软件应用 热图绘制 GO数据库查询 KEGG数据库查询 DAVID功能富集分析 STRING数据库挖掘互作关系 Cytoscape绘制基因互作网络 关键基因（hub节点）寻找 MCODE子网络模块挖掘 | 通过自己动手进一步理解高通量数据挖掘的理念，掌握常用软件的使用。 |
| 16:00-17:00 | 交流与答疑 | ||
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通过生信大数据分析，提炼并研究科学问题的科研人员、研究生、博士生、有科研需求的临床医生 / 企事业单位的研发技术人员 |
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1. 零基础入门级，无需生物信息学背景、无需编程能力，教你如何运用现有数据库挖掘有价值科研信息 |
| 讲师简介 | 课程预期 |
陈博士，北京协和医学院博士毕业，目前在大型综合三甲医院专职科研，发表SCI论文十余篇，擅长生物信息学与基础医学交叉研究、数据库信息挖掘及数据可视化。 | 1. 学会利用现有公共数据库挖掘相关疾病潜在靶点的思路 |
联系方式：
培训地点：上海 报名咨询：张依寒 13681810839（微信同号） 邮箱：zhang.yihan@foxmail.com; wservice@acadeevent.com |
