高通量芯片及测序技术的快速发展和应用积累了海量的生物学数据,多个数据库诸如GEO、TCGA、ArrayExpress等被建立用来存储、查询以及分析挖掘有意义的生物信息。这些数据库具有免费、公开、操作界面友好的特点,几乎覆盖了所有器官、组织、细胞相关的基因组、转录组、表观组、蛋白质组等数据。了解这些数据库,掌握数据挖掘的相关技巧将有助于我们快速寻找靠谱的研究靶点,提高科研的质量和效率,发表高质量的SCI论文,奠定基金申请所需的前期工作基础等。
适用人群
通过生信大数据分析,提炼并研究科学问题的科研人员、研究生、博士生
有科研需求的临床医生
企事业单位的研发技术人员
课程特点
1. 零基础入门级,无需生物信息学背景、无需编程能力,教你如何运用现有数据库挖掘有价值科研信息
2. 交互式数据分析和探索,从多个数据源获取数据,并将数据转化为可用的形式
3. 以教学为目的,具有指导性、学习性,内容集中,通俗易懂,学完能够快速上手
4. 理论与实操相结合,注重思路与案例带教齐头并进,真正有效帮助生物医学研究人员对相关技术的掌握和灵活运用
课程安排
时间安排 | 课程内容 | 介绍 | |
2019年10月19日 | |||
09:00-10:20 | 生物数据挖掘与科研 |
| 了解掌握生物大数据挖掘的背景知识 |
10:40-12:00 | 常用数据库 |
| 掌握生物数据解读、查找和存储的能力 |
13:30-15:00 | 差异表达分析 |
| 无需编程,快速实现差异基因表达分析和可视化,掌握绘制热图的常规软件 |
15:20-17:00 | 功能富集分析 |
| 掌握GO、KEGG、DAVID等数据库的使用 |
2019年10月20日 | |||
09:00-10:20 | 基因/蛋白互作分析 |
| 熟练运用Cytoscape绘制高质量的基因/蛋白互作网络图,并掌握利用网络拓扑性质实现关键靶点的挖掘策略 |
10:40-12:00 | 数据挖掘相关SCI文章解析 |
| 经典文章解析进一步理解数据挖掘的相关思路 |
13:30-16:00 | 实操 |
| 通过自己动手进一步理解高通量数据挖掘的理念,掌握常用软件的使用。 |
16:00-17:00 | 交流与答疑 |
讲师介绍:
陈博士,北京协和医学院博士毕业,目前在大型综合三甲医院专职科研,发表SCI论文十余篇,擅长生物信息学与基础医学交叉研究、数据库信息挖掘及数据可视化。
课程预期
1. 学会利用现有公共数据库挖掘相关疾病潜在靶点的思路2. 掌握实现数据挖掘的关键软件3. 数据可视化及高质量科研图片绘制
培训地点:北京
报名咨询:
张依寒 13681810839 (微信同号)
邮箱:zhang.yihan@foxmail.com; wservice@acadeevent.com