在转录组分析入门的过程中,您是否遇到这些的问题:看了一篇篇的入门干货,依然无从下手;因缺少数据分析的环境,空有一肚子的理论无法实践;按照教程一步步操作,可就是无法产生相同的结果;面对种类繁多的数据挖掘工具,不知怎么选择?
为解决大家在转录组分析入门过程中遇到的痛难点,华大基因学院特推出《转录组入门实操专题》培训,培训课程由经验丰富的一线讲师坐镇,理论知识与上机实操双管齐下,从零基础到实战,手把手带您入门转录组分析。
培训时间:2020年4月24日-28日
培训形式:远程在线
注:可回放
【授课形式】
直播授课+社群辅导+直播答疑+1v1在线指导操作
【课程特色】
一站式课程
提供稳定的转录组分析环境;
系统的讲解从测序下机数据开始直到数据挖掘的整个过程及所使用的最优软件;
一流的讲师
依据丰富的项目实践经验,为您讲解转录组项目设计过程考虑的关键问题、操作过程中常见的错误及解决方案
全方位课程辅导
课前:提供社群辅导;
课间:在直播间为您答疑;
课后:设置专门的操作练习时间并配助教实时答疑;
专属课程福利
提供华大内部自编上机实操手册
赠送3门视频课程,供课前预习并提供社群辅导
赠送操作所需全部代码提供1v1远程指导,吃透每一个实操步骤
预习课前预习:视频课程+社群辅导
《Linux基础知识》
《R语言基础知识》
《二代测序原理》
第1天《转录组基础及前沿进展》2
020年4月24日(周五) 19:00-21:00
转录组测序技术概述
转录组项目设计要点(样本数/测序量/测序读长/测序平台)
转录基本产品和内容介绍(无参/有参转录组/非编码RNA)
常用数据库介绍(NCBI/Ensembl/Genconde/KEGG/GO/Genecards)
新技术与新方向(三代全长转录组/高通量单细胞RNA-Seq)
第2天《转录组数据基本分析》
2020年4月25日(周六) 9:30-11:30
测序数据过滤和质控
有参转录组序列比对(Hisat2的使用)
基因表达定量(StringTie的使用)
基因差异表达分析(DEseq2的使用)
功能注释和GO/pathway的分类
富集分析(ClusterProfiler包的使用)
可视化IGV的使用
Excel实战分析
第2天在线操作练习及答疑
2020年4月25日(周六) 18:00-20:00
直播答疑,重点击破实操练习遇到的重难点
1v1远程指导,吃透每一个实操步骤
第3天《lncRNA测序数据分析》
2020年4月26日(周日) 9:30-11:30
lnRNA生物学基础及应用
转录本拼接(StringTie的使用)
转录本去冗余(cuffcompare/gffcompare的使用)
lncRNA的鉴定(getorf/CPC2)◆ lncRNA与mRNA的互作分析
lncRNA与miRNA的互作分析(psRobot的使用)
lncRNA分析实例
第3天在线操作练习及答疑
2020年4月26日(周日) 19:00-21:00
直播答疑,重点击破实操练习遇到的重难点
1v1远程指导,吃透每一个实操步骤
第4天《miRNA测序数据分析》
2020年4月27日(周一) 9:30-11:30
miRAN生物学基础及应用
miRNA测序数据分析过程
miRNA的定向和定量(bowtie比对/balst比对)
miRNA的差异分析(DEGseq/DEseq2的使用)
miRNA靶基因预测(psRNAtarget/TargetScan/mirnada/RNAhybrid的使用)
miRNA功能分析
miRNA-mRNA关联分析
cytoscape软件的使用
第4天在线操作练习及答疑
2020年4月27日(周一) 19:00-21:00
直播答疑,重点击破实操练习遇到的重难点
1v1远程指导,吃透每一个实操步骤
第5天《转录数据深度挖掘》
2020年4月28日(周二) 15:00-17:00
WGCNA共表达分析
GSEA富集分析
时间序列分析
转录因子分析
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