Python是一种简单易学,功能强大的编程语言。它有高效率的高层数据结构,能够简单、有效地实现面向对象编程。Python语法简洁,支持动态输入,是解释性语言。在大多数平台上,对于众多领域,Python都是一个理想的开发语言,特别适合于应用程序的快速开发。Python在生物信息领域更是有着广泛的用途,几乎是入门生物信息学的首选编程语言。
课上针对目前实用的众多python扩展包,例如科学计算、网络爬虫等都会有所涉及。
培训特色:
1、全面的课程--技术应用、原理流程、实例联系全贯穿
2、理论知识与上机操作相结合,为每位学员提供实际操作机会
3、增值服务,课下主讲老师将为您实际工作中遇到的问题提供个性化解答
培训目标:
掌握生物信息学与Python的基础知识,学会Python执行最常见的编程,了解BioPython的基本应用,通过生物信息学Python程序实例与应用,深刻理解并掌握生物信息学Python语言使用的要点。
主办单位:北京市计算中心
授课形式:线上直播
课程安排:2020.5.27-29 上午9:30-11:30 下午13:30-17:00
课程内容:
一、基因组关联分析理论基础
1、基因组学与生物信息学概述
2、基于群体遗传的数据获取
3、基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件介绍
4、常用GWAS数据库介绍
二、GWAS计算机基础
1、Linux基础for GWAS
2、R基础for GWAS
三、Plink软件基础应用
1、Plink软件应用
2、Plink文件格式生成与解析
3、等位基因频率计算
4、哈-温平衡计算
5、基因组关联分析流程
6、关联分析结果分析与p校正
四、基因型填充Imputation
1、基因型填充Imputation的原理及应用
2、基因型填充软件介绍与应用
3、基因组填充的方法与分析流程
4、1000G数据应用
五、关联分析应用
1、基于家系的关联分析
2、曼哈顿图的绘制与结果展示
3、实操for Plink
六、关联分析应用
1、单倍型介绍
2、单倍型分析
3、LD连锁不平衡指数计算
4、实操
5、Tassel软件介绍
报名费用
注册费:3600元/人(含本次听课费、上机账号1个、资料费、证书费、考试费(如有),赠送一年内同等金额同课程体系线下班一个和线下7折班一个。)。
备注:若您不方便参加线下班可将赠送的线下班换成2个线上班。
开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。
课程结束后,可将上课期间用到的数据、PPT资料、脚本、视频等相关文档,通过移动硬盘邮寄的方式快递到您手上,便于您后续继续学习使用。
报名优惠政策
1、3人以上团体报名每人可减少300元;
2、4+1团报,可免费赠送一个名额;
3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;
老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。
包年优惠价
按年付费,45000元/人。包括报名后1年以内所有线上+线下课程,全年免费参加;高性能计算资源基础账号1个,使用期限1年。
付费方式
银行账号信息:
单位全称:北京市计算中心
账号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息备注:“生物计算——您的姓名”,个人汇款请备注“生物+您姓名+单位名称”)
咨询请联系
QQ号:3498448850
邮箱:bcc_peixun@163.com
张老师 18618295767(微信同号)
于老师 15621925881
【注】开课前三天会发送邮件通知;确认开课后,开课前一天会将直播链接及上机账号发至您邮箱或微信。如未收到,请及时电话咨询。