【线上】基因组关联分析技术应用培训班(买一赠一)

作者:   2020-04-20
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Python是一种简单易学,功能强大的编程语言。它有高效率的高层数据结构,能够简单、有效地实现面向对象编程。Python语法简洁,支持动态输入,是解释性语言。在大多数平台上,对于众多领域,Python都是一个理想的开发语言,特别适合于应用程序的快速开发。Python在生物信息领域更是有着广泛的用途,几乎是入门生物信息学的首选编程语言。

课上针对目前实用的众多python扩展包,例如科学计算、网络爬虫等都会有所涉及。

培训特色:

1、全面的课程--技术应用、原理流程、实例联系全贯穿

2、理论知识与上机操作相结合,为每位学员提供实际操作机会

3、增值服务,课下主讲老师将为您实际工作中遇到的问题提供个性化解答

培训目标:

掌握生物信息学与Python的基础知识,学会Python执行最常见的编程,了解BioPython的基本应用,通过生物信息学Python程序实例与应用,深刻理解并掌握生物信息学Python语言使用的要点。

主办单位:北京市计算中心

授课形式:线上直播

课程安排:2020.5.27-29  上午9:30-11:30   下午13:30-17:00

课程内容:

一、基因组关联分析理论基础

1、基因组学与生物信息学概述

2、基于群体遗传的数据获取

3、基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件介绍

4、常用GWAS数据库介绍

二、GWAS计算机基础

1、Linux基础for GWAS

2、R基础for GWAS

三、Plink软件基础应用

1、Plink软件应用

2、Plink文件格式生成与解析

3、等位基因频率计算

4、哈-温平衡计算

5、基因组关联分析流程

6、关联分析结果分析与p校正

四、基因型填充Imputation

1、基因型填充Imputation的原理及应用

2、基因型填充软件介绍与应用

3、基因组填充的方法与分析流程

4、1000G数据应用

五、关联分析应用

1、基于家系的关联分析

2、曼哈顿图的绘制与结果展示

3、实操for Plink

六、关联分析应用

1、单倍型介绍

2、单倍型分析

3、LD连锁不平衡指数计算

4、实操

5、Tassel软件介绍

报名费用

注册费:3600元/人(含本次听课费、上机账号1个、资料费、证书费、考试费(如有),赠送一年内同等金额同课程体系线下班一个和线下7折班一个。)。

备注:若您不方便参加线下班可将赠送的线下班换成2个线上班。

开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。

课程结束后,可将上课期间用到的数据、PPT资料、脚本、视频等相关文档,通过移动硬盘邮寄的方式快递到您手上,便于您后续继续学习使用。

报名优惠政策

1、3人以上团体报名每人可减少300元;

2、4+1团报,可免费赠送一个名额;

3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;

老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。

包年优惠价

按年付费,45000元/人。包括报名后1年以内所有线上+线下课程,全年免费参加;高性能计算资源基础账号1个,使用期限1年。

付费方式

银行账号信息:

单位全称:北京市计算中心

账号:0200151819100023937

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息备注:“生物计算——您的姓名”,个人汇款请备注“生物+您姓名+单位名称”)

咨询请联系

QQ号:3498448850

邮箱:bcc_peixun@163.com

张老师 18618295767(微信同号)

于老师 15621925881

【注】开课前三天会发送邮件通知;确认开课后,开课前一天会将直播链接及上机账号发至您邮箱或微信。如未收到,请及时电话咨询。

编辑: 会议君    来源:丁香园

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