Python 是一种简单易学,功能强大的编程语言。它有高效率的高层数据结构,能够简单、有效地实现面向对象编程。Python 语法简洁,支持动态输入,是解释性语言。在大多数平台上,对于众多领域,Python 都是一个理想的开发语言,特别适合于应用程序的快速开发。Python 在生物信息领域更是有着广泛的用途,几乎是入门生物信息学的首选编程语言。
课上针对目前实用的众多 python 扩展包,例如科学计算、网络爬虫等都会有所涉及。
培训特色:
1、全面的课程--技术应用、原理流程、实例联系全贯穿
2、理论知识与上机操作相结合,为每位学员提供实际操作机会
3、增值服务,课下主讲老师将为您实际工作中遇到的问题提供个性化解答
培训目标:
掌握生物信息学与 Python 的基础知识,学会 Python 执行最常见的编程,了解 BioPython 的基本应用,通过生物信息学 Python 程序实例与应用,深刻理解并掌握生物信息学 Python 语言使用的要点。
主办单位:北京市计算中心
协办单位:
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
北京市计算中心—工信部和信息化人才培养工程培训基地
北京市计算中心—北京市大数据教学实践基地
听课方式:线上直播、现场听课,按需选择。
课程安排:2020.8.26-29 上午 9:30-11:30 下午 13:30-17:00
第一天
Python 概述及其在生物信息领域的应用:概括介绍 Python 语言的概念及特点,及其在生物信息领域的应用
Python 软件安装、运行与基本操作:Python 及 iPython 的安装及使用,Python 程序的运行;DOS、Unix 命令行操作基本命令;Python 变量定义、数字及基本运算
核心数据类型:列表、元组
基本语法结构:判断结构、循环结构、异常处理
实例练习:使用 python 编程,生成斐波那契数字序列
第二天
核心数据类型(2):字符串、字典
文件与文件夹操作:文件的读入与写入、文件夹操作
实例练习:FASTA 文件的处理:
1、序列基本信息的统计(序列数、碱基数、及平均长度)
2、fasta 序列反向互补转换和切割
第三天
函数和模块:系统库函数、第三方函数、自定义函数;模块定义、导入、使用
正则表达式:Python 特色功能正则表达式学习与应用
实例练习:系统命令在 python 中的调用
实例练习:大数据文件的分割及合并
第四天
BioPython 简介及应用实例:BioPython 安装及学习,生物信息学中的实际应用
BioPython 快速应用:使用 BioPython 处理传统的生物信息数据
实例练习:
应用 biopython 实现 genbank、uniprot 格式数据转换为 fasta 格式。
应用 biopython 在 blast xml 结果文件中提取目的信息。
注:课程以实际发生为准;若调,会提前通知。
【报名费用】
线上直播:4200 元/人
含本次听课费、资料费、证书费、考试费 (如有)。
赠送一年内同等金额同课程体系线下班一个和线下 7 折班一个(备注:若您不方便参加线下班可将赠送的线下班换成 2 个线上班。)
现场听课:3600 元/人
含本次听课费、资料费、证书费、考试费 (如有)。
开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。
课程结束后,可将上课期间用到的数据、PPT 资料、脚本、视频等相关文档,通过移动硬盘邮寄的方式快递到您手上,便于您后续继续学习使用。
【报名优惠政策】
1、3 人以上团体报名每人可减少 300 元;
2、4+1 团报,可免费赠送一个名额;
3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;
老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠 200 元。
【包年优惠价】
按年付费,45000 元/人。包括报名后 1 年以内所有线上课程;高性能计算资源基础账号 1 个,使用期限 1 年;线下培训名额 2 个。
【付费方式】
银行账号信息:
单位全称:北京市计算中心
账号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息备注:「生物计算——您的姓名」, 个人汇款请备注单位名称)
注:款项支出后,请提供付款回执给工作人员,方便核实到账、开具发票。
【报名回执】
访问此链接填写报名回执 https://www.wjx.top/jq/80710449.aspx
【咨询请联系】
QQ 号:2814500767
邮箱:bcc-sxpx@bcc.ac.cn
徐老师 010-59341786,15801436028(微信同号)
员老师 010-59341773,18701529461(微信同号)
【注】开课前三天会发送邮件通知;确认开课后,开课前一天会将直播链接及上机账号发至您邮箱或微信。如未收到,请及时电话咨询。
- 会议时间: 2020-08-26至 2020-08-29
- 会议地点: 北京
- 电话:010-59341786
- 传真:
- 联系人:徐老师
- Email: bcc-sxpx@bcc.ac.cn
- 联系地址:
- 会议网址:http://bioc.bcc.ac.cn/bcc/China/shengwuxinxipeixun/
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