2014.11.17-19 实用工具与软件专题培训

时间

课程名称

课程内容

第一天
上午

9:00~10:30

生物信息学导论与前沿

1、基因组学与生物信息学背景知识介绍；
2、生物信息进展与前沿技术介绍;

10:40~12:10

生物信息学数据库及公共资源介绍

生物信息学数据库及、公共资源应用GenBank、RefSeq、UniProt、Ensembl、PDB等；

第一天
下午

13:30~17:00

实用生物信息学分析与软件介绍

1、序列格式与转换；
2、Bioedit操作序列；
3、Blast序列检索（在线+本地）；
4、ClustalW/X序列比对；
5、Mega序列分析与进化分析；

第二天
上午

9:00~12:00

专业生物信息在线数据库及工具

1、基因本体数据及GO注释；
2、生物学通路KEGG注释方法与实现；
3、基因组浏览器；

第二天
下午

13:30~17:00

Linux与Perl、R语言的应用

1、Linux系统操作；
2、shell脚本的编写；
3、大型服务器的操作；
4、Perl语言基础与介绍；
5、R语言基础与介绍；

第三天
上午

9:00~12:00

蛋白质组学与技术

1、蛋白质组学研究与蛋白质结构分析；
2、Swiss-PDB Viewer、PyMol等蛋白结构分析软件的使用；
3、Amber在分子动力学研究中的应用；
4、Cytoscape在蛋白相互作用网络可视化中的应用

第三天
下午

13:30~16:30

生物信息学论文绘图及发表要求

1、科技论文绘图基础知识；
2、论文绘图方法；
3、实用绘图与实现方法及软件应用；
4、科技论文图表发表要求与注意事项；

16:30~17:30

自主练习与交流讨论