2015.1月《重测序数据分析专题培训》_北京市计算中心

日期

授课题目

授课内容

第一天

重测序研究背景及理论

• 生物信息学知识背景概述；
• 二代测序的基本概况和技术发展简介；
• 重测序的基本概念、研究历史、内容和意义；
• 重测序研究策略以及技术、前沿热点及趋势；

Linux上机操作及生物信息学软件安装

• linux基础基本操作；
• 生物信息学软件应用及常用软件介绍、重测序相关分析软件介绍及安装；

第二天

动物、植物、微生物重测序的案例分析应用及分析流程（个体水平）

• 动物重测序理论与案例分析；
• 植物重测序理论与案例分析；
• 微生物重测序理论与案例分析；

重测序分析上机练习（以细菌和植物为例）

• 重测序的分析流程；
• 原始测序数据的质控及过滤；
• 学习bwa，samtools,pindel等工具的使用，进行calling SNP、INDEL、SV，变异注释及功能分析；

第三天

重测序(外显子组测序)在群体遗传学中的应用（群体水平）

• 群体遗传学理论：
• 进化分析；
• GWAS分析；

群体水平测序数据分析实例
（上机操作）

• 混池重测序的进化分析流程；
• 孟德尔疾病的外显子组测序分析流程；
• 低覆盖度重测序与缺失基因型填充（Imputation）分析流程；
• 复杂疾病的重测序GWAS分析流程。

□实用生物信息学培训班  □科研论文绘图研习班 □重测序专题研习班
□宏基因组分析专题研讨班  □Perl语言专题班  □转录组专题研习班

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□中心主页 □邮件宣传（张利英、员丽丽）□海报 □单页 □销售员  □丁香园  □生物论坛  □生物通邮件   □生物360  □朋友推荐               

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住宿明细

入住时间：
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房间类型

□大床间
□标准间（和       合住）
□拼房（与其他学员拼标准间）

备注：