Python是一种解释型、面向对象、动态数据类型的高级程序设计语言。由于Python语言的简洁、易读以及可扩展性,在国内外用Python做科学计算的研究机构日益增多,在生物信息学和医学领域已经有大量程序软件全部或部分使用Python来设计。Python的使用率呈线性增长,已经成为最受欢迎的程序设计语言之一。Python目前拥有很多专用的科学计算扩展库,例如十分经典的科学计算扩展库NumPy、SciPy和生物信息学专用的Biopython,它们分别为Python提供了快速数组处理、数值运算以及绘图功能,还有专门的生物信息学处理分析功能。因此Python语言十分适合工程技术、科研人员处理实验数据、制作图表,甚至开发科学计算应用程序。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生物学、医学、农学等人员开展了此培训,帮助大家快速开展生物信息数据各项分析。欢迎您报名参加!
主办单位:北京市计算中心,生物计算事业部
举办地:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
培训时间:2015.5.14-5.17日
培训内容及安排:
日期 | 时间 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 09:30-10:30 | Python概述及其在生物信息领域的应用 | 概括介绍Python语言的概念及特点,及其在生物信息领域的应用 |
10:30-12:00 | Python软件安装、运行与基本操作 | Python及iPython的安装及使用,Python程序的运行;DOS、Unix命令行操作基本命令;Python变量定义、数字及基本运算 | |
13:30-15:00 | 核心数据类型(1) | 列表、元组 | |
13:30-16:00 | 基本语法结构 | 判断结构、循环结构、异常处理 | |
16:00-17:00 | 实例练习 | 使用python编程,生成斐波那契数字序列 | |
第二天 | 09:30-11:00 | 核心数据类型(2) | 字符串、字典 |
11:00-13:00 | 文件与文件夹操作 | 文件的读入与写入、文件夹操作 | |
13:30-17:00 | 实例练习 | FASTA文件的处理:1、序列基本信息的统计;2、序列反转和切割 | |
第三天 | 09:30-11:00 | 函数和模块 | 系统库函数、第三方函数、自定义函数;模块定义、导入、使用 |
11:00-12:00 | 正则表达式 | Python特色功能正则表达式学习与应用 | |
13:30-14:30 | 实例练习 | 系统命令在python中的调用 | |
14:30-17:00 | 实例练习 | 大数据文件的分割及合并 | |
第四天 | 09:30-11:00 | BioPython简介及应用实例 | BioPython安装及学习,生物信息学中的实际应用 |
11:00-12:00 | BioPython快速应用 | 使用BioPython处理传统的生物信息数据 | |
15:00-17:00 | 实例练习 | 应用biopython实现genbank、uniprot格式数据转换为fasta格式。 | |
授课实例 |
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(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)
【培训特色】
1、对口生物信息; 2、非严格语法,适合初学;
3、功能强大、跨平台;4、灵活易用
【报名费用】 注册费:3200元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。
【付费方式】现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心 账号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”)
【报名优惠政策】
1、2014年3月1日前报名,可优惠100元。(限非团报人员)
2、4+1团报,可免费赠送一个名额
培训座位按收到报名表先后顺序安排。
【联系咨询】
张老师 010-59341771 ,18618295767,QQ号:2814500767,邮箱:zhangly@bcc.ac.cn
员老师 010-59341773, 18701529461 , 邮箱:yuanll@bcc.ac.cn
报名回执表:
培训班类型:(可多选) | □实用生物信息学培训班 □科研论文绘图培训 | ||||||||||||||||
姓名: |
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| 职称: |
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身份证号 |
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工作单位: |
| 住宿: | 是□;否□ | ||||||||||||||
研究方向: |
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通讯地址: |
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固定电话: |
| 手机: |
| E-mail: |
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报名种类: | A□ B□ (该选项仅报名生物信息培训班人员填写) | ||||||||||||||||
对课程了解情况 | ☆☆☆☆☆ | 感兴趣的课程: |
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信息渠道: | □中心主页 □邮件宣传(张利英、员丽丽)□海报 □单页 □销售员 □丁香园 □生物论坛 □生物通邮件、主页 □朋友推荐 | ||||||||||||||||
发票抬头: |
| 发票内容: |
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住宿明细 | 入住时间: | 房间类型 | □大床间 | ||||||||||||||
备注: |
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确定报名后,请将回执表发到上述联系人邮箱里。如在两日内没有收到回复,请电话联系确认。