IPA应用与数据分析

作者:   2015-11-17
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  • 会议时间: 2015-12-10至 2015-12-12
  • 会议地点: 北京
  • 电话:18910809780
  • 传真:
  • 联系人:王老师
  • Email: swyxpx@163.com
  • 联系地址:
  • 会议网址:

IPA应用与数据分析培训班 

主办单位:北京市计算中心生物计算事业部
源资信息科技(上海)有限公司   

培训时间: 2015年12月10日-12日  (火热报名中)

培训地点:北京市计算中心三层会议室 (北京海淀区丰贤中路7号3号楼)    
 

随着基因组序列测定的费用越来越低,收集一个人遗传信息的速度也越来越快,我们能够更好地检测预防疾病、个性化定制药物疗法,并对海量的医学研究数据进行个性化处理。这种技术上的进步会让大部分人长期保持健康,同时这种基因图谱和分析技术是一种新兴的医学专业,世人称之为“精准医疗”。

“精准医疗”时代的来临和大数据的爆发,如何有效利用大数据技术将队列数据、临床数据、组学数据、结构生物学数据、药物分子信息等数据进行挖掘和处理,通过生物信息学的手段发现新靶点、新结构、新药物、新方案、新标准和新规范是目前的首要任务。Ingenuity Pathway Analysis (IPA) 基于后台高度结构化的Ingenuity Knowledge Base知识库,包括人工阅读提取的几百万条公开发表的科研成果和报告,可用于分析、整合、理解来自于基因表达,microRNA,SNP,RNA-Seq,SNP-Genotyping微阵列的数据,代谢物组学和蛋白质组学的实验数据,和一些可产生基因、化学品列表的小规模实验的数据,得到可靠的深入的分析结果,从而实现“精准医疗”。 

本次培训主要针对进行各种组学研究的科研工作者,讲解基于这些组学数据进行的IPA生物通路分析,能得到什么样的分析结果,以及怎样基于这些分析结果来帮助我们深入地解释各种组学数据。操作培训包括查询功能、数据上传,以及分析结果讲解等。
 

【授课安排】授课内容以实际为准,
时间为上午 9:00 -12:00,下午13:00 - 16:30。
日期授课题目授课内容
12月10日(第一天)IPA与Ingenuity知识库概述
特邀报告一:Systems-Biology Approaches to Drug Discovery and Developement(系统生物学导引药物研发)报告人:李英雄 教授 中国台湾
特邀报告二:An Overview of IPA(IPA概述)IPA简介、功能与应用、介绍Ingenuity强大的知识库
IPA数据管理与查询功能
1. IPA操作界面与基本操作
2. 数据文件格式与导入
3. Ingenuity知识库查询
4. 基因/蛋白相关知识背景与通路查询、数据过滤、精炼与知识挖掘
5. 疾病相关基因/蛋白/药物等数据与文献查询
12月11日(第二天)
核心分析与分子网络
1. 创建新的核心分析项目(Core Analysis)
2. 鉴定数据中的作用方向与生物学效应
3. 预测上游调节因子
4. 分子互作网络构建与分析
对比分析及其它
1. 创建对比分析(Comparison Analysis)
2. 深入检验多组学平台、多时间点、多试验组别差异分析
3. IPA与Ingenuity知识库高级功能使用
4. IPA项目管理与数据共享12月12日
(第三天)IPA应用案例
1. IPA使用案例介绍
2. 实际案例与分析流程讲解
结业考试及专题讨论
1. IPA技术与应用结业考试
2. 结业考试结果反馈与解答
3. 专题讨论
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。 
【讲师团队】
1、李英雄 教授,中国台湾,现任中山医学大学讲座教授暨中山医学大学附属总院执行长,中国科学院客座研究员,曾任长庚大学医学院院长,中国医药大学副校长,北京大学客座教授等。2、QIAGEN Advanced Genomic Group Manager
3、裴智勇 博士,北京市计算中心生物计算事业部技术总监,从事生物信息数据分析与专业软件应用工作,在国内发表基因组学、生物学通路、大分子相互作用相关的论文多篇,具有较丰富的生物学、医学数据处理与高性能计算机的运用、程序开发及数据挖掘经验。
4、闫鹏程 博士,北京市计算中心生物计算事业部副经理。研究方向主要集中在转录组测序、基因组测序和疾病基因组分析,以及海量数据的生物信息学分析平台构建等方面,在生物信息高性能计算领域有丰富经验。
【报名费用】  注册费: 3000元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。
【付费方式】 现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心     
 账号:0200151819100023937 
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部—您的姓名”,个人汇款请备注上单位名称)
【报名优惠政策】1、11月20日前报名成功并缴费每人可优惠300元(限非团报人员)。2、 4+1团报,可免费赠送一个名额 ;培训座位按收到报名表先后顺序安排。
 【联系信息】王老师  18910809780   邮箱:swyxpx@163.com
报名学员来电来邮件索取报名回执。

编辑: 杨俊岭   

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