Genome Analyzer(原Solexa)高通量测序培训班
（2009年六月11、12号）
为促进GA高通量测序技术在国内各个研究领域的应用，上海敏芯信息技术有限公司联合Illumina公司和上海明烨生物技术有限公司于2009年6月中旬共同举办Genome Analyzer(原Solexa)高通量测序技术培训班，为广大科研工作者提供Genome Analyzer(原Solexa)高通量测序技术的原理、应用实例和实验设计思路、尤其是后期的数据分析等方面的培训。
培训包括两个模块：模块1课堂讲解 （第一日）
模块2上机实践 （第二日）
时间： 2009年六月10号、11号（2天）
培训地点：上海市国定路335号复旦创业园（复旦大学本部）
报名方式：http://www.ebiotrade.com/custom/illumina/090413/index.htm#02
为保证本次培训的质量，我们将限定学员人数为25人！确保每个学员能得到详细的指导。
Genome Analyzer(原Solexa)高通量测序培训班
课程表
（2009年六月中旬 两天）
课堂讲解
课程内容 培训讲师
生物信息学前沿 钟扬 教授（复旦大学）
GA高通量测序仪原理 刘雪燕（Illumina公司市场部经理 ）
GA高通量测序仪测序实验操作 王珺（浙江大学纳米研究所）
GA高通量测序仪数据分析原理及操作 曾华宗（敏芯科技总经理）
GA测序数据分析精彩实例 刘极龙（敏芯科技技术支持）
上机实践：
第二天上午：mRNA GA数据分析实践——刘极龙，卢益甄
1.tag序列提取及计数 2.差异检验统计方法
3.tag-to-gene映射方法 4.基因聚类分析方法
5.Gene ontology分析方法 6.信号通路分析方法
7.基因network分析方法 8.创新的一些方法
第二天下午：microRNA GA数据分析分析实践——刘极龙，卢益甄
1.未见报道的新microRNA的发掘 2.microRNA靶基因预测方法
3.分析转录因子在microRNA启动子区域的结合位点 4.转录因子与microRNA的调节环路
5.microRNA cluster分析 6.microRNA 功能聚类分析
7.microRNA与信号通路 8.创新的一些方法
【师资介绍】
钟扬教授——复旦大学生命科学学院常务副院长，为您生动讲述生物信息学前沿技术。
教授，日本国立综合研究大学院大学生物系统科学博士。中国生物物理学会生物信息学与理论生物物理专业委员会主任委员。主要研究领域为分子进化和生物信息学。近五年来共发表学术论文70余篇，其中SCI核心期刊60余篇。2000年起任复旦大学生命科学学院教授, 植物学和生物信息学博士生导师。兼任上海生物信息技术研究中心副主任和“科学通报”特约编辑等职。
刘雪燕——Illumina公司市场部经理，为您详细阐述GA原理
王珺——英国University of Dundee博士，利用实验设计方面的丰富经验为您讲解GA测序实验操作
负责浙江大学浙江加州国际纳米技术研究院高通量测序平台建立和数据分析。自测序平台建立以来，已针对肝癌、胃肠癌成功开展了基因组重测序、全新基因组测序、mRNA测序、ChIP-Seq、miRNA测序、多样本混合测序等多项研究。
曾华宗——上海敏芯信息科技有限公司总经理，为您详述GA数据分析原理及操作
复旦大学生物信息学博士。五年生物信息学背景，以第一作者或通讯作者发表过多篇高质量的生物信息学文章，现担任上海敏芯信息科技有限公司总经理。对GA在表达谱、microRNA、转录本及CHIP等方面的应用积累了丰富的经验。
刘极龙——上海敏芯信息科技有限公司项目经理，指导学员进行基因组学、转录组学和生物信息学数据分析和实践
厦门大学博士。具有独立开发的高通量测序数据分析pipeline。可以分析microRNA-GA、mRNA-tag-GA、ChIP-Seq和RNA-seq等数据类型。擅长不同来源的数据的整合分析以及基因网络分析。可以对高通量测序数据进行深度挖掘，从而为实验提供指导。
Genome Analyzer高通量测序技术应用
1、测序与重测序
无论您需要测定的是整个基因组的序列还是基因组上一个大片断候选区域的序列， Illumina Genome Analyzer系统都是当今世界上最先进、最经济的平台。Solexa测序技术和可逆中止化合物染料（reversible terminator chemistry）奠定了在下一代测序技术中高质量、高通量、低成本数据产出的基础。
2、表达谱分析
通过对样本中数以百万计的cDNA标签同时进行序列测定，Genome Analyzer系统可以使您对整个转录组进行数字化的分析，而成本仅仅维持在与目前其他模拟化分析技术同样的水平。由于我们的技术无需利用任何转录子特异性杂交探针，您可以同时进行全基因组转录子的发掘与定量分析，而无需事先知道基因组的注释情况。
3、小RNA鉴定与定量分析
Genome Analyzer高通量测序技术可以提供一套全新独特的，适用于各个物种的小RNA深度鉴定与定量分析研究平台。通过大量的平行测序，研究人员可以发掘、鉴定并定量出任何物种全基因组水平的小RNA图谱。应用这种低成本快速测定数百万标签序列的新方法，Illumina Genome Analyzer提供了解密小RNA图谱独一无二的方法。
主办单位：上海敏芯信息科技有限公司
协办单位：Illumina公司
上海明烨生物科技有限公司
