近年来,以新一代测序技术为代表的高通量研究技术发展突飞猛进,带动基因组学从“以大规模测序为目的”到“以大规模测序为手段来解决科学问题”的转型。高通量手段将带动实验生物学手段的一个革新,正如十多年前基因芯片和质谱学的发展一样。与基因芯片和质谱学单一的应用领域不同,此次高通量测序技术的变革将渗入到实验生物学的诸多方面,影响不可低估。本次培训将回顾基因组学与测序技术的发展。介绍新一代测序技术在基因组、转录组研究以及转化研究领域的应用。
培训内容及安排:
培训时间:2012年5月31日-6月1日
Workshop Agenda | ||
上课时间 | 内容 | 报告人 |
5月31日 | ABI |
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9:00-11:00 | Principle of NGS platforms |
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11:00-12:00 | Common and useful tools for NGS data analysis |
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13:30-15:00 | De novo tools and subsidiary |
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15:10-16:30 | Application and data analysis of RNA-seq in NGS |
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6月1日 | CLC |
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9:00 – 9:20 | CLC Bio NGS data analysis solution |
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9:20 – 9:45 | Installation, Introduction of software interface & functionalities | |
9:45 – 10:30 | Reference Mapping | |
10:30 – 10:45 | Break | |
10:45 – 11:30 | SV, SNP, small InDel detection | |
11:30 – 12:00 | De novo assembly (part 1) | |
12:00 – 13:00 | Lunch | |
13:00 – 14:00 | De novo assembly (part 2) | |
14:00 – 14:30 | RNA-seq | |
14:30 – 15:00 | Small RNA | |
15:00 – 15:10 | Break | |
15:10 – 15:40 | ChIP-seq | |
15:40 – 16:00 | Genomics Gateway | |
16:00 – 16:30 | Q & A |
System requirement:CPU: 1.8 GHz or higher, RAM: 2GB or more, HD space: 10GB or more报名费用:
注册费:1500元/人(含听课费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。
付费方式:
现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心
账号:0200151819100023937 开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
如需发票请注明发票抬头,培训结束后统一开具发票(培训费、注册费、会议注册费、技术服务费、信息服务费等),有其他特殊要求请声明。
培训地及乘车路线:
培训地点:北京市海淀区丰贤中路7号 北京市计算中心三层会议室
行车路线:地铁13号线 西二旗A口出 乘570路(永丰—西二旗)丰贤中路下车即到;365路(永丰—闵庄年里)在丰贤中路下车即到;438路皇后店西下车,步行500米即到;384路到圆清路北口换成365路到丰贤中路下车即到;
协办单位:
北京路思达生物信息科技有限公司 北京标凯科技有限公司
报名或咨询请致电:
员丽丽010-59341767或发邮件yuanll@bcc.ac.cn注明“GenomicsWorkbench workshop”
姓名: |
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身份证号: |
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工作单位: |
| 住宿: | 是□;否□ | ||||||||||
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信息渠道: | □中心主页 □朋友推荐 □邮件宣传 □校内网 □海报 □单页 □销售员 □丁香园 □生物通 □其他 | ||||||||||||
备注: |
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请认真填写以上内容,并于2012年5月30日前寄回。如有其它需要,请在备注中说明。