2017.8.18——8.21 功能基因组、长非编码 RNA、表观遗传学 培训班

作者:   2017-07-17
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  • 会议时间: 2017-08-18至 2017-08-21
  • 会议地点: 济南市
  • 电话:13683111214
  • 传真:
  • 联系人:张爱国
  • Email: 1256090094@qq.com
  • 联系地址:
  • 会议网址:

本期培训班有着丰富的内容,前沿科研技术,培训班中包括了非编码 RNA 的功能研究策略与科研设计,研究关键技术等,涵盖长链非编码 RNA、小分子 RNA 与表观遗传学的完整解决方案,理论讲解和实验操作结合,让你更快更好地掌握时下科研技术与科研方向。

培训内容:
一、DNA 测序技术-原理及技术
a) 第二代测序技术:Illumina,454, Ion Torrent 原理
) 第三代测序技术:PacBio, Hellicos 原理
c) 第四代测序技术:Oxford NanoPore 原理 d)Hybridization based methodse) 测序技术的比较及展望 

二、基因组编辑技术(CRIPR 技术)
a) 不同基因组编辑技术的比较 Meganuclease,ZFN,TALEN,          
)CRISPR-Cas9
c)CRISPR-Cas 系统的作用机理
d)CRISPR-Cas 系统在基因组编辑中的应用
e)CRISPR-Cas 系统的其他应用 

三、生物信息学基本实验技能
a)Linux 常用命令
)EMBOSS,经典序列分析工具集
c)Perl 编程基础

四、小 RNA(microRNA)研究方法及案例
a) 实验流程
) 数据处理比对
c) 靶基因富集分析
d )miRNA-mRNA 关联分析
e) 主要工具包的使用:miRDeep,mirDeep* 

五、长非编码 RNA(lncRNA)研究方法及案例
a) 实验流程
)lncRNA 的发现和分类
c) 功能分类
d) 主要工具包的使用:lncRScan,LncRNAFunction 等  

六、表观遗传学研究方法及案例
a )DNA methylation, MeDIP-seq
)Histone modifications, ChIP-seq, ChIP-exo
c )Nucleosoem positioning and occupancy, MNase-seq
d )Chromatin accessibility, DNase-seqe )3D chromatin structure, 3C, 4C, 5C, Hi-C 

七、基于 DNA/RNA 测序技术的功能基因组学研究策略分析
a )ARNA Transcription: ChIRP-Seq, GRO-Seq, Ribo-Seq, CLIP-Seq
)RNA structure: SHAPE-Seq, PARS-Seq, FRAG-Seq, CAP-seq
c )Low-level RNA detection: Quartz-Seq, DP-Seq, Smart-Seq, d
d )Smart-Seq2e )Low-level DNA detection: smMIP, MDA, MALBAC, OS-Seq 

八、R 语言基础 
a)R 和 R studio 的安装
)从 bioconductor 下载安装 packages 
c)R 绘图基础,correlation matrix ,dot plot         

非编码 RNA 和表观遗传学是近年来生命科学领域的研究热点,非编码 RNA 在包括发育、免疫、生殖等基本生理过程中扮演了不可替代的角色,同时在包括多种重大疾病中也发挥重要作用。2016 年,表观转录组分析(Epitranscriptome analysis)荣膺 Nature Methods 年度生命科学技术,目前已知的 RNA 修饰超过 100 种,其中很多修饰能参与到真核基因表达调控。非编码 RNA 和 RNA 表观遗传学的研究,将加深人类对生命系统复杂调控网的理解和认识,并为疾病的研究和治疗提供新的视角,有望从中发现新的分子标志物与治疗靶点。 

报名须知:
1. 注册费:4300 元/人;(包括培训费、资料费、上机费、考试费等;食宿统一安排,费用自理)
2. 团体优惠:同一单位 5 位学员参加,可额外赠送 1 个免费名额;
3. 本次培训班共 35 个名额,培训座位按收到报名表先后顺序安排。 

主办单位:中国科学院计算技术研究所 烟台分所
培训地点:山东大学 计算中心
培训时间:2017.8.18——8.21
联系人:张爱国
联系电话:13683111214
咨询电话:010-58032788
邮箱:1256090094@qq.com

编辑: 会议君   

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