生物信息学Perl语言培训初级班

Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选计算机语言之一，具有功能强大，跨平台运行，操作简单高效等特点，且有巨大的第三方代码库CPAN作支持，十分适用于生物信息研究。北京市计算中心生物计算事业部，针对生物学、医学、农学等背景的且有从事生物信息学研究工作人员的需要，特开设Perl语言零基础初级班。

主办单位：北京市计算中心，生物计算事业部

举办地点：北京，北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

培训时间：2013年6月16-19日

报名截止：2013年 6月15日

培训内容及安排：

第一天

09:30-10:00  生物信息学与Perl语言概述；概括介绍生物信息学背景与Perl语言的概念及特点

10:00-10:20  软件安装与运行环境调试；Perl语言解释器、编辑器安装，Perl程序运行测试

10:20-12:00  基本操作与基本概念；DOS、Unix命令行操作基本命令；Perl语言基本变量与操作符

13:30-16:00  基本变量；变量、字符串赋值、基本运算上机练习

第二天

09:30-12:00  基本语法结构；判断结构；循环结构；上机练习

13:30-16:00  数组及应用；数组的概念及用法；上机练习

第三天

09:30-11:00  文件与文件夹操作；文件的读入与输出；文件夹操作；练习

11:00-12:00  二维数组与hash表及应用；二维数组概念、关联数组(hash表)概念及用法；上机练习

13:30-16:00  常用函数及子程序；常用Perl语言基础函数学习；子程序概念与应用；上机练习

第四天

09:30-12:00  正则表达式及生物信息学Perl程序实例；Perl特色功能正则表达式学习与应用；生物信息学实例程序学习；上机练习

13:30-16:00  Bioperl简介、CAPN简介、常用生物信息学数据库与软件简介；Bioperl简介与安装；Perl第三方代码库CAPN简介；常用生物信息学数据库简介、数据类型与应用；常用生物信息学软件数据格式及软件应用简介

编辑： 小蒋