2018 年 1 月 19—22 海口 DNA 条形码与分子标记培训班

作者:   2018-04-04
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  • 会议时间: 2018-01-19至 2018-01-22
  • 会议地点: 海口市
  • 电话:13683111214
  • 传真:暂无
  • 联系人:张爱国
  • Email: 1256090094@qq.com
  • 联系地址:北京 海淀
  • 会议网址:

培训大纲:
一 、分子鉴定的应用
1、微生物、动物、植物资源普查
2、检验检疫
3、中药材真伪鉴定
4、食品质量安全
5、疾病诊断和预防
6、分子育种

二、DNA 测序技术-遗传检测的利器
1、第一代测序技术:Sanger 测序原理
2、第二代测序技术:Illumina,454, Ion Torrent 原理
3、第三代测序技术:PacBio, Hellicos 原理
4、第四代测序技术:Oxford NanoPore 原理
5、Hybridization based methods6、测序技术的比较及展望

三、Sequence-independent 分子标记的开发及应用
1、Restriction fragment length polymorphism(RFLP)
2、Random amplified polymorphic DNA(RAPD)
3、Simple sequence repeats(SSR)
4、Single strand conformation polymorphism(SSCP)
5、Cleaved amplified polymorphic sequence(CAPS)
6、Sequence characterized amplified region(SCAR)
7、Amplified fragment length polymorphism(AFLP)
8、Inter-retrotransposon amplified Polymorphism(IRAP)
9、REtransposon-microsatellite amplified polymorphism(REMAP)

四、equence-dependent 分子标记开发及应用
1、常用的 DNA 条形码标记:ITS,ITS1,ITS2,trnH-psbA,rbcL-matK,COI 等
2、常用 DNA 条形码鉴定方法:sequence similarity-based(Blast, Hidden Markov Model),tree-based,cutoff-based
3、筛选最优 DNA 条形码指标
⑴PCR amplification success
⑵Sequencing efficiency
⑶Species distinguishing power
⑷DNA barcoding gapDNA barcoding 相关数据库
⑴BOLD: Barcode of Life Database
⑵BOMMD: Barcode of Medicinal Materials Database

五、基于全基因组序列的新的分子标记的发现
1、(真菌、动物)线粒体基因组⑴测序方案: 实验方法纯化还是生信方法纯化⑵组装方法:de novo vs. reference based⑶注释流程: MFAnnotator vs. FUMGA⑷特异性标记筛选流程
2、(植物)叶绿体基因组⑴测序方案:实验方法纯化还是生信方法纯化⑵组装方法:de novo vs. reference based⑶注释流程:CPGAVAS vs. DOGMA⑷特异性标记筛选流程

六、物理图谱和遗传图谱构建新方法:
原理及应用 1、Optical Map
2、Bionano
3.reduced-representation sequencing using reduced-representation libraries (RRLs) 
4、complexity reduction of polymorphic sequences (CRoPS),
5、Restriction-site associated DNA sequencing(RAD-Seq)

了解更具体的通知  红头文件,可以联系张爱国老师。 
报名办法及费用:3900 元/人含报名费、资料费、上机费、证书费用等 ,(同一单位报名 5 人,可以免 1 人费用),食宿可统一安排,费用自理。
报名参会,可以将报名回执表填好,发送到会务组邮箱。 
联系人:张爱国联系电话:136 8311 1214
办公电话:010-58032788
会务组邮箱:zky_hwz@vip.163.com

编辑: 潘文娟    来源:丁香园

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