测序与芯片高通量数据挖掘与分析学习班

生物信息学（bioinformatics）定义：
是在大分子方面的概念型的生物学，并且使用了信息学的技术，这包括了从应用数学、计算机科学以及统计学等学科衍生而来各种方法，并以此在大尺度上来理解和组织与生物大分子相关的信息。

生物信息学魅力：
帮助预测疾病相关的潜在基因，以及该基因潜在的作用靶点、上游调控转录因子等，从而指导实验方向、缩小试验范围、简化试验流程。        
为基金申请提供支持，通过强大的信息数据的收集整理，减少投入增强研究目的性；且通过整合技术优势，指导提高临床诊断水平。        
丰富的免费的数据资源和生物软件工具：数据库：NCBI, EBI, DDBJ, PDB,SWISS-PROT 等；软件工具：Cytoscape，BLAST,  R 语言，String,  David 等。
本次培训目的：      
很多老师都做过测序或者芯片实验，虽然测序公司已经给出了一部分的数据分析，比如过滤、质控、比对、定量和差异等，但是这些分析属于基础傻瓜式的标准分析，并不能完整的讲一个故事！因此，需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力，从海量信息中获得自己想要的关键基因！
培训预期： 
通过 2 天的培训，使学员掌握生信文献分析思路和 8 个实用操作知识点（具体见最后），可以独立完成一篇基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。

第一天上午第一节：
基因数据库使用介绍测序标准报告的解读。
CBI Gene 数据库：最权威的基因综合数据库之一。
CBI GEO 数据库：数据量最大的高通量公共数据库。
GEO2R 工具：在线做差异分析的 R 工具
ioDBnet：在线基因 ID 转换工具。
Uniprot：最权威的蛋白综合数据库之一。

第一天上午第二节：
DAVID 工具——功能富集分析        
功能富集的原理和意义基因 ID 转换         
基因功能注释（GO ，KEGG pathway）        
基因功能富集（GO ，KEGG pathway）         
基因功能聚类（GO ，KEGG pathway）

第一天下午第三节 
聚类热图及 pathwaymap 图
KEGG  数据库：最权威的通路数据库（pathway map  分析）
HEMI 软件：构建聚类热图的本地软件

第一天下午第四节.
TRING 工具——基因/蛋白相互作用分析（PPI）
蛋白互作分析的原理和意义；         
单个蛋白的蛋白互作分析；         
多个蛋白的蛋白互作分析；        
TRING 工具的使用步骤：输入、参数设置、输出等

第二天上午第五节
cytoscape 网络做图软件（上）         
网络图构建         
逐个修改节点的属性和修改边的属性       
网络展示方式 layout 更美观        

第二天下午第六节 
cytoscape 网络做图软件（下）        
批量修改节点的属性和修改边的属性        
Cytoscape 的常用插件：ClusterONE        
Cytoscape 的常用插件：BinGO

第二天下午第七节 
答疑环节

讲师宋博士简介： 
成果：参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。  研究方向：有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通 perl、R 等编程语言。
培训经历：在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。
培训的对象有：医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。
培训方向：《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R 语言培训》等

学习班时间与地点

上海班
培训时间：2018 年 5 月 26-27 日 、8 月 4-5 日、11 月 17-18 日
培训地点：  上海好望角大饭店   上海市肇嘉浜路 500 号  

北京班
培训时间：2018 年 7 月 14-15 日
培训地点：北京金泰绿洲大酒店     北京市东城区永外彭庄甲 58 号

广州班
培训时间：8 月 18-19 日        
培训地点：广州凯荣都国际大酒店     广州市海珠区江海大道 3 号

南京班：培训时间：9 月 29-30 日
培训地点：待定
深圳班：培训时间：12 月 29-30 日  
培训地点：待定
学习办主办：医药加学习班
学习班承办方：上海遐永医药科技
学习班赞助方：尔云生信

收费标准： 
注册费：2500 元每位（注册费包含电子版教材、午餐，住宿费自理。）
优惠政策：1.  提前确认报名及转账的，可以提前拿到学习材料 2.  三人组团报名，每人可优惠 100 元 3.  四人组团报名，每人收费 2300 元，4.   五人组团报名缴费，额外带一人免费注册！   可以开正规会务发票，纸质邀请函（盖红章）。
特别说明：如果需要学习班的上外网路由神器，用于上 google 学术等国外网站，请自己在邀请函上加 900 元，我们会在你们的会务费发票上加 900 元，给您开发票，如果不需要神器，就是按照我们邀请函上的价格，神器可以至少保证用 2 年以后。 

报名咨询电话：021-50327163
金老师：18917745941
王老师：13818765978
学习班秘书微信号 yiyaojia01

编辑： 会议君