北京精准医学与药物基因组学

作者:   2018-09-19
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  • 会议时间: 2018-10-26至 2018-10-29
  • 会议地点: 北京
  • 电话:17600011681
  • 传真:暂无
  • 联系人:陈文文
  • Email: 1092713056@qq.com
  • 联系地址:
  • 会议网址:

近年来,随着我国精准医疗产业迅速发展,精准医疗技术的研究与应用取得了长足的进步。精准医学研究作为科技部国家重点研发计划重点专项,对构建国家大型健康队列和重大疾病专病队列,建立多层次生物医学大数据共享平台,建立大规模疾病预警、诊断、治疗与疗效评价体系等方面具有重要意义,是显著提升人口健康水平、实施健康中国战略过程中不可或缺的一部分。精准医学的最终目的是实现对于疾病和特定患者的个体化精准治疗,提高疾病的诊治与预防效益,而精准用药正是实现这一目标的重要环节。在医药分开持续推进的过程中,药师转型的速度明显加快,药师群体也希望提升自身业务水平以适应这次改革浪潮。同时,近几年基因检测飞速发展,测序技术的突破也带动了药物基因组学的发展,这为临床提出了更高要求。为进一步推动我国生物信息学方面的发展,提高从业人员的技术水平,由北京中科云畅应用技术研究院举办「精准医学与药物基因组数据分析」高级培训班,具体事宜通知如下:
一、课程特点:
1、系统介绍科研项目如何从大思路着眼进行海量数据挖掘;
2、结合各大项目实践经验,详细介绍多种数据分析软件的使用方法;
3、理论课与实践课相结合,讲师与学员研讨的方式进行;
4、精心挑选相应的上机软件,为每位学员提供实际操作的机会;
5、课下主讲老师为您所遇到的瓶颈问题提供个性化解答。 
二、培训对象:
生命组学科、精准医学和中医药研究机构、临床科研人员,大学、医院等专家学者。大中专院校生物信息、生物计算、生命科学、医学、教研室骨干人员、教学管理人员;科研单位从事医学、生物、生命科学、相关人员;生物、医药、化学及相关企业的领导与技术骨干。  
三、时间地点:       2018 年 10 月 26 日——10 月 29 日   第 1 天报到,授课 3 天                               
四 、培训内容  
基因组学技术在临床中的应
1. 外显子捕获测序(WES)技术
2.WES 筛选疾病致病基因策略
3. 基于 NGS 的肿瘤个体化数据分析
4. 临床案例分析
5. 生存分析基本概念以及常用分析方法  

基因组学技术在致病基因发现
1. 药物基因组学分析
2. 临床案例分析
3. 应用二代测序技术研究发病机理、开发临检标志物   

宏基因组与精准医疗
1.16S rDNA AMPLICON SEQUENCING 法
1.1. 测序平台、引物设计及区域选择不同测序平台、针对细菌、真菌不同微生物实验设计
1.2. 测序量及采样建议
1.3. 分析流程图
1.4. 结果解析
2. DSS(direct shotgun sequencing)法

R 语言绘图(ggplot2)
R 语言基本介绍
1、 R 语言基本运算、向量函数
2、R 语言数据读入以及导出
3、ggplot2 基本绘图(条形图、散点图、折线图等)
4、部分生存分析实例讲

变异位点分析软件 GATK 上机操作
1. 基本信息分析: raw data 数据整理及数据质量评估;
2. 数据通过 GATK, SAMtools 等检测 SNP 和 InDel 变异信息;
3. 将 SNP 和 InDel 与 dbSNP 和千人基因组数据进行比对分析;
4. 变异所在基因的功能注释;

16S 分析软件 QIIME 上机操作
一、Linux 系统操作简介
1.1 Linux 简史
1.2 Linux 与生物信息学
1.3 Linux 基本命令
1.4 Linux 基本操作综合实践
二、QIIME 上机操作
1. 笔记本电脑配置要求建议笔记本内存 4 G 以上,64 位操作系统
2. 针对 16S rDNA amplicon sequencing 分析
2.1. 虚拟机安装:Virtual Box
2.2. 16S 分析运行环境搭建:QIIME Virtual Machine
2.3. 实例演示及结果展示数据预处理 OTU 聚类物种注释 OTU table 生成α多样性分析序列比对构建进化树β多样性分析
3. 针对 shotgun sequencing 分析(只做流程演示讲解)
3.1. 序列质量控制:fastqc
3.2. 序列拼接
3.3. 基因预测及丰度分析
3.4. 物种注释 3.4. 功能注释
3.5. MetaSPAdes、MEGAN、metAMOS 等软件介绍

五、主讲专家:中国科学院北京基因组研究所,拥有丰富的科研及工程技术经验,长期从事生物信息领域项目研究,具有资深的技术底蕴和专业背景。

六、报名办法及费用:      学费 3900 元(含报名费、培训费、资料费、上机费等相关费用)食宿统一安排,费用自理。请直接与联系人联系报名!
陈文文 :17600011681       邮箱:1092713056@qq.com

编辑: 潘文娟   

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