生物信息学Python语言培训通知

作者:   2018-11-20
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  • 会议时间: 2018-12-13至 2018-12-16
  • 会议地点: 北京
  • 电话:18618295767
  • 传真:
  • 联系人:张老师
  • Email: bcc_peixun@163.com
  • 联系地址:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
  • 会议网址:

生物信息学中常用的语言是Perl,不过最近Python语言很火,Python是一个高层次的结合了解释性、编译性、互动性和面向对象的脚本语言。它设计简洁,具有很强的可读性,相比其他语言更有特色的语法结构。Python目前拥有很多专用的科学计算扩展库,生物信息学专用的Biopython,提供了生物信息学处理分析功能如快速数组处理、数值运算以及绘图,已经有大量程序软件全部或部分使用Python来设计。

越来越多的科研人员学习Python语言处理实验数据、制作图表。在学习编程的路上,您可能看过很多Python电子书、Python教程和视频依然不会Python编程!如果有个导师给您指导,您会走的更快、更好一些!北京市计算中心自2011年起已成功举办100多期生物信息类培训班,学员累计达1500人次,其中不乏教授、博导。不少学员通过培训建立了长期协作关系,共同申请国家课题,共同发表论文。特聘请行业一线项目经验丰富的科研人员精心组织了生物信息学Python语言培训课程,专业老师帮助大家学习编程语言,不用再担心枯燥无味,学员与老师之间互动讨论,可对重点知识实践快速掌握,快速学会Python!诚邀您报名参加!

培训对象:从事生命科学、医学、农学等领域科研工作者和高校教师及研究生及致力于从事生物信息分析的在校大学生及求职者

主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

承办单位:北京市计算中心

协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室、中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会、北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心、中国生物工程杂志、北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司、深圳微生太科技有限公司、北京依托华茂生物科技有限公司

举办地点:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

培训时间:2018.12.13~16(共4天)

培训内容及安排:

日期

时间

授课题目

授课内容

第一天

09:30-10:30

Python概述及其在生物信息领域的应用

概括介绍Python语言的概念及特点,及其在生物信息领域的应用

10:30-12:00

Python软件安装、运行与基本操作

Python及iPython的安装及使用,Python程序的运行;DOS、Unix命令行操作基本命令;Python变量定义、数字及基本运算

13:30-15:00

核心数据类型(1)

列表、元组

15:00-16:00

基本语法结构

判断结构、循环结构、异常处理

16:00-17:00

实例练习

使用python编程,生成斐波那契数字序列

第二天

09:30-11:00

核心数据类型(2)

字符串、字典

11:00-13:00

文件与文件夹操作

文件的读入与写入、文件夹操作

13:30-17:00

实例练习

FASTA文件的处理:1、序列基本信息的统计(序列数、碱基数、及平均长度);2、fasta序列反向互补转换和切割

第三天

09:30-11:00

函数和模块

系统库函数、第三方函数、自定义函数;模块定义、导入、使用

11:00-12:00

正则表达式

Python特色功能正则表达式学习与应用

13:30-14:30

实例练习

系统命令在python中的调用

14:30-17:00

实例练习

大数据文件的分割及合并

第四天

09:30-11:00

BioPython简介及应用实例

BioPython安装及学习,生物信息学中的实际应用

11:00-12:00

BioPython快速应用

使用BioPython处理传统的生物信息数据

15:00-17:00

实例练习

应用biopython实现genbank、uniprot格式数据转换为fasta格式。
应用biopython在blast  xml结果文件中提取目的信息。

(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)

培训特色:

1、一流的讲师团队--基因组学专家与一线分析人员亲自授课;

2、全面的课程--技术应用、原理流程、实例联系全贯穿

3、理论知识与上机操作相结合,为每位学员提供实际操作机会

4、增值服务,课下主讲老师将为您实际工作中遇到的问题提供个性化解答

5、小班教学,每期培训班的人数不超过35人。

培训费:4500元,含听课费、材料费、上机费。请自带笔记本电脑用以上机实习。

材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。食宿自理,酒店自行预定。

【报名优惠政策】

1、3人以上团体报名每人可减少300元

2、4+1团报,可免费赠送一个名额

3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排

编辑: 会议君   

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