微生物组学分析研讨班
近年来，微生物组学在医疗、环保、资源开发、科研领域都发挥着举足轻重的作用，成为了上述领域必不可少的研究技术。在此，北京市计算中心生物部为您提供了最前沿、最实用的微生物组学课程《微生物组学分析研讨班》。为您在微生物组学研究中样品制备、实验设计、数据分析、结果展示等方面的困扰提供一键式解决方案。
专业一流的讲课老师团队将与您一起探讨科研奥秘、挖掘科学价值，为您拓宽科研思路、解决实验困扰。欢迎报名参加！
主办单位：中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位：北京市计算中心
培训地点: 北京海淀区丰贤中路7号3号楼
培训时间： 2019.1.14-16（报名中）
本次课程时间： 上午：9:30-12:00下午：13:30-17:00
日期 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 上午 | 微生物组学研究的发展和挑战 | 1、微生物组研究的发展历史 2、测序平台介绍 3、基于测序的研究方法 3.1 宏基因组（target sequencing 和全基因组） 3.2 单个微生物de novo测序 4、应用案例分析 |
第一天 下午 | target sequencing数据分析 | 1、linux常用命令使用和上机操作 2、数据分析过程中的编程简介（perl、R、python等） 3、target sequencing数据分析加上机 3.1质控 3.2去嵌合体 3.3 OTU聚类 3.4 注释 3.5统计分析：（1）α多样性分析；（2）β多样性分析；（3）群落结构及丰度分析；（4）进化分析；（5）差异分析(Lefse)；（6）功能分析(picrust)。 |
第二天 全天 | Whole metagenome 和metatranscriptome数据分析 | 1、质控 2、拼接组装：SOAPdenovo；MetaVelvet; Meta-IDBA等 3、聚类Binning：TETRA; MetaCluster; Phymm等 4、基因注释：FragGeneScan；MetaGeneMark；MetaGeneAnnotator等 5、功能注释：RAMMCAP；Blast等 6、统计分析：（1）物种分析；（2）功能分析；（3）差异分析；（4）表达分析 |
第三天 全天
| 微生物de novo测序分析 | 1、 质控 2、 单细胞测序去污染、去嵌合体等 3、拼接组装：SPAdes等 4、基因预测 5、功能注释 6、代谢途径分析 7、进化分析：（1）SNP；（2）插入缺失（3）水平基因转移； 8、转录组分析：（1）基因差异表达分析；（2）代谢通路分析 |
(课程内容以实际授课为准)
【报名费用】 注册费：4000元/人（含听课费、资料费、上机费，请自带笔记本电脑以备上机实践使用）。材料：《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。
【报名优惠政策】
1、2019.1.1日前报名并缴费的学员每人可优惠200元；
2、3人以上团体报名每人可减少300元；
3、 4+1团报，可免费赠送一个名额；
4、上面4种优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。
