生物信息学软件与工具使用培训班通知
「工欲善其事,必先利其器」,对于从事生物信息学研究,软件和工具绝对是必不可少的。您对生物信息学常用的软件和工具可能进行过简单的了解和使用,但您可能在使用的过程中会遇到各种各样的疑问,如面对众多的生物信息学分析软件却不知该如何选择应用?对于软件繁杂的使用方法和众多参数不知如何取舍?
为了解决您遇到的困扰,打开您的思绪,北京市计算中心生物计算事业部举办《生物信息学软件与工具使用培训班》。介绍生物信息学研究及数据分析中所用的各种数据库使用,通过实际项目演练,学习常用分析软件的使用方法,将课程各项知识点融会贯通,从而使学员深刻理解并掌握生物信息学数据库和工具使用的要点。大家赶快一起来交流探讨吧!一流的学员和经验丰富的老师在这里等着你的到来!
授课对象: 全国生命科学、基础医学、农林科学等领域大专院校、科研机构、公司企业从事分子生物学、生物化学、遗传学、基因组学等研究、开发和教学的第一线研发人员和青年教师、博士后和研究生。
主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:北京市计算中心
培训地点:北京海淀区丰贤中路 7 号 3 号楼,北京市计算中心三层会议室
本次课程时间: 2019.1.21-24 上午:9:30 - 12:00 下午:1:30 – 5:00
日期 | 时间 | 课程名称 | 课程内容 |
第一天 上午 | 09:30- 10:30 | 生物信息学概述与前沿 | 1. 基因组学与生物信息学背景知识介绍 2. 生物信息进展与前沿技术介绍 |
10:30-12:00 | CBI 数据库 | CBI 数据库介绍:PubMed、Nucleotide(GenBank)、Genome、Structures(MMDB)、Taxonomy、UniGene、Entrez 等,数据查询检索 | |
第一天 下午 | 13:30-15:00 | CBI 数据库 | 2. NCBI 数据库数据上传提交与批量下载 3. NCBI 数据库实例讲解与练习 |
15:00-17:00 | last 与序列比对 | 1. Blast 与序列检索比对及参数 2. Blast 建库与 Blast 本地化 3. 实例讲解与练习 | |
第二天 上午 | 09:30-12:00 | MEGA 软件与分子进化 | 1. 分子进化理论基础 2. MEGA 与系统发育树构建 3. 实例讲解与练习 |
第二天 下午 | 13:30-17:00 | 分子网络与生物学通路分析 | 1. 分子相互作用数据库与通路概述(Uniprot,String,DIP 数据库) 2. 分子网络分析工具 Cytoscape 及插件使用 3. 实例讲解与练习 |
第三天 上午 | 09:30-12:00 | 基因组注释 | 1. 基因本体数据库 GO 及 GO 注释 2. 生物学通路 KEGG 注释方法与实现 3. David 与基因注释 4. IPA 简介,查询搜索,通路分析与网络构建 |
第三天 下午 | 13:30-15:30 | 疾病和基因突变数据库 | 1. GeneCard 数据库介绍及使用 2. HGMD(人类基因突变数据库)数据库介绍及使用 |
15:30-17:00 | 药物基因组数据库 | 1. PharmGKB 数据库介绍及使用 2. PGMD 数据库介绍及使用 | |
第四天 上午 | 09:30-12:00 | 表观遗传学 | 1. Encode 数据库介绍及使用 2. Roadmap 数据库介绍及使用 3. RegulomeDB 数据库介绍及使用 |
第四天 下午 | 13:30-15:30 | 蛋白质 3D 结构 | 1. 蛋白质结构分析概述 2. PDB 数据库介绍与使用 3. PyMol 蛋白质结构分析软件介绍与使用 |
15:30-17:00 | 软件与生物统计应用 | 1. 生物统计概述 2. SPSS 使用与生物统计应用 3. 实例讲解与练习 |
(课程内容以实际授课为准)
注:参加培训班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表。
【报名费用】培训费 4000 元/人,含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑用以上机实习。材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社;近最近酒店为:如家酒店(永丰店),可自行网上预定,食宿自理。
【报名优惠政策】
1、2019.1.7 日前报名并缴费可优惠 200 元;
2、3 人以上团体报名每人可减少 300 元
3、4+1 团报,可免费赠送一个名额;
以上优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
以收到学员培训费为成功报名,座位按收到费用先后顺序安排。