时间地点：2019年1月10日——1月13日（北京）
报名电话：010-- 5947 9271
联系人：薛炎 176 1026 5591
邮箱： zkcc_bis@vip.163.com
主办方：中科成创（北京）生物技术有限公司
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理论内容：
一、宏基因组学
1. 16S rDNA AMPLICON SEQUENCING 法
1.1. 测序平台、引物设计及区域选择不同测序平台、针对细菌、真菌不同微生物实验设计
1.2. 测序量及采样建议针对水体、粪便、土壤、物体表面、口腔等不同生境
1.3. 分析流程图数据收集、数据预处理、数据分析
1.4. 结果解析
1.4.1 OTU聚类
1.4.2 物种注释
1.4.3 物种分布情况
1.4.4 样品复杂度分析：α多样性CoverageChao指数ACE指数Shannon曲线Richness rarefaction曲线
1.4.5 多样品比较分析：β多样性样品间物种丰度热图排序分析：PCA分析PCoA分析NMDS分析Unifrac分析样品聚类分析
2. DSS （direct shotgun sequencing）法
2.1. 分析流程
2.2. 功能注释分析
2.3. 代谢途径解析
二、宏转录组学
1 介绍
2 物种组成、功能及代谢途径分析宏基因组优势菌分析
1.泛基因组分析
2.宏基因组中的优势菌株单基因组分析
上机实习：
一、宏基因组中的优势菌株单基因组常规分析流程
1.原始数据评估 （fastqc）
2 基因组拼接、画图（CGview等）
3 功能注释 （KEGG、CARD、Resfinder等）
4 进化树分析 （MEGA、evolview）
5 多菌株泛基因组分析 (PanGP)
二、宏基因组学（16S部分）介绍以及上机操作
1.Virtual box 及Qiime
2 安装
2.Linux基础知识介绍
3.Qiime
2：数据处理， 质控， 生成feature， 进化树构建， 多样性分析， 差异分析， 物种注释
三、R语言基础及宏基因组相关统计分析
1.常用基本命令变量赋值文件读写常用的统计函数
2.差异OTU及差异菌群分析wilcox检验
3.相关性检验差异OTU与样本临床信息相关性检验
4.alpha多样性
5.beta多样性
6.PCoA7.机器学习逻辑回归随机森林svm
报名办法及费用：
每人￥3900元（含报名费、培训费、资料费、证书费）
报名优惠：12月16日之前成功报名汇款享受报名费95折优惠。
团队报名：4+1优惠。（5位其中1位免除费用）
食宿可统一安排，费用自理。
各单位人员报名参加，报名回执表请回传至会务处即可。
如单位有内训需求，请将内训方案传至会务组，根据单位需求安排相应专家进行
