本次培训提供了一次系统掌握TCGA和SEER等癌症公共数据库数据结构、挖掘方法及分析流程的机会,目的在于助力有志于利用这些公共数据库的临床医生以及转化研究的科研人员,帮助研究者去更好地挖掘利用这些免费的公共数据。
本次培训不侧重于深入的生物信息学分析讲授,拟解决的问题包括:
1、如何基于TCGA及SEER等癌症公共数据库设计课题;
2、TCGA及SEER数据库的数据下载;
3、获取数据后如何分析;
4、如何在此基础上撰写SCI论文及申请科研基金。
本次主讲老师是来自国内知名三甲医院肿瘤专业的临床医生和科研工作者,有着丰富的临床和转化研究经验。以一作和通讯作者发表SCI论文26篇,10分以上论文4篇,累计影响因子176。其中成功用TCGA、SEER数据库发表十几篇SCI,平均影响因子4.6分一篇。目前主持国家自然科学基金面上项目及多项省部级人才项目,担任一本SCI杂志的Sectioneditor,以及多本影响因子5分以上SCI杂志审稿人。
课程大纲
第一天上午:TCGA数据库入门
1.什么是TCGA?
2.哪里获取TCGA数据?(实战)
3.如何利用TCGA数据撰写论文?
第一天下午:SEER数据库入门
1.什么是SEER?
2.哪里获取SEER数据?(实战)
3.如何利用SEER数据撰写论文?
第二天上午:TCGA和SEER数据深度挖掘
1.如何深度挖掘公共数据库并进行临床转化课题设计
2.实战:利用Excel、SPSS、Graphpad进行基于TCGA数据挖掘
3.实战:利用R程序进行TCGA和SEER数据挖掘
第二天下午:论文标书撰写与实用统计方法
1.SCI论文撰写技巧
2.实用科研统计方法实战
3.医学基金标书撰写技巧