用R语言进行科研数据挖掘实战会议

作者:   2019-03-27
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  • 会议时间: 2019-04-27至 2019-04-28
  • 会议地点: 广州市
  • 电话:13621834129
  • 传真:暂无
  • 联系人:王老师
  • Email: msh088@126.com
  • 联系地址:
  • 会议网址:

无实验无数据没关系,挖掘别人的数据,发表自己的文章两天一夜高强度实训,讲究实战,所有经验和盘托出会后赠讲课录像便于反复复习保障效果(加密播放不零售,保障学员优势权利)

第八期 2019/04/27-28 广州 (会议时间两天&一晚)

第九期 2019/05/18-19 上海 (会议时间两天&一晚)

莫速乎主办,

还在认为没有实验就不能发表论文?还在为不精通挖掘GEO,TCGA,SEER的数据库而痛苦不堪?还在为不知道如何找课题找靶点而苦恼?还在为不会那些高大上的图表而暗自伤神?快来参加莫速乎的科研数据挖掘实战专题学习班吧,挖掘别人的数据,发表自己的文章,一次学习,不再报班!

本会议由于带着明确的目的性去学习R语言,且针对有/无R语言基础的学员均具有很大宽容性,自开班起就广受好评。随着近年来生物信息学技术的普及,R语言是每个科研工作者都有必要掌握的技能,以往漫无目的的学习R效果不理想,用R去进行科研数据挖掘,既学习了R又解决了实际科研问题。

学完课程并掌握后能干什么:

1.没有课题的时候找到课题,没有机制的时候挖掘机制

2.为基金申请保驾护航,发表paper如虎添翼

3.掌握R语言的核心技能,GEO,TCGA,SEER的数据处理没有压力

4.科研绘图:以一敌百,高端大气,私人订制。

这是一份带有诚意且注重实战的数据挖掘课程。我们的目标是:一次学习,不再报班。

课程特点:

1.不留秘密,私货全出,全程只用R语言,关键步骤不隐藏。

2.第一天晚上时间充分利用,增加带有讲师指导的练习,更多的训练时间,更好的掌握。

3.讲最核心的知识,讲通用的技能,学后可应用到其他数据库的挖掘。

4.实例操作(至少3个套路),让你快速掌握数据挖掘套路。

5.现场完成一篇paper的思路以及图表。

主讲人简介:我们有幸邀请到具有丰富经验的老师进行两天一晚的高强度实操训练,目标是让大家一次学习不再报班。本会议自举办以来场场爆满,好评不断。讲师来源于生物信息大号 “果子学生信”公众号创始人团队。作为临床科研工作者,深知无课题之苦,因此愿将所学知识和盘托出,没有隐藏。网上超过1万个免费的生信帖子来源于他们,致力于给非生信专业人员普及生物信息学,擅长各种组学的处理,且讲课诙谐幽默。

适合人群:广大临床/科研工作者及心有热血被困囚笼的研究生

内容安排

第一天

08:30-11:55

R语言基础知识介绍

R语言数据结构以及循环控制(向量,因子,矩阵,数据框,列表,for循环,if控制)

编写自己的第一个批量处理数据的程序

R语言中数据框的操作(增删改查)

真实数据的清洗和整理

R包以及bioconductor资源的使用

R包无敌安装攻略

R语言绘图系统

11:55-13:30统一午餐

13:30-17:00

TCGA数据库背景介绍+阅读文献

TCGA相关的网页工具汇总学习

介绍不同的癌症和不同组学

不同的分析套路解读(WGCNA,signatures,miRNA-mRNA配对或者ceRNA等)

TCGA数据分析的软硬件准备

下载及理解TCGA数据(所有数据)

R制作TCGA表型数据临床三线表

17:00-18:00统一晚餐

晚上18:00-21:00

R语言数据框的操作练习(掌握tidyr和dplyr)

GEO数据库成套流程实战(数据清洗,热图,火山图,气泡图)

如何根据需求绘制一个漂亮的火山图(学习ggplot2)

使用R语言制作特定肿瘤所有基因表达的数据库

第一天答疑,消化,为第二天做准备

第二天08:30-11:55

差异分析(表达数据,表达矩阵归一化,DESeq2)

任意癌症任意基因在癌和癌旁的表达

如果有亚型,在不同亚型中的表达

如果有肿瘤有分期,在不同临床分期中的表达

单个基因在多个正常组织中的表达

单个基因在多个细胞系中的表达

单个基因在多个肿瘤中的表达

两个基因的相关性如何分析

聚类注释与图表展示(GO/KEGG,GSEA)

使用多种统计算法定位 signatures cox,lasso回归

生存分析

绘图美化

任意癌症中任意基因的生存分析

任意癌症中批量生存分析

TCGA文章的框架分析以及复现

答疑环节

11:55-13:00统一午餐

13:00-16:30

利用GEO和TCGA数据库找到课题

利用GEO和TCGA数据库发掘下游机制

如何利用GEO和TCGA数据库申请基金

如何利用GEO和TCGA数据库发表文章

现场完成一篇生信文章的所有图表

提出科研假设

根据科研假设下载整理数据导入R语言

在R语言中清洗和整理数据达到对应R包的要求

数据处理过程中调整分析策略

绘制各个部分需要的图标

时间地点:

第八期 2019/04/27-28  广州春天里精品酒店  (会议时间两天&一晚)

地址:广州市天河区燕岭路95号(燕塘地铁站旁)

第九期 2019/05/18-19 上海维也纳国际酒店(天山西路店)(会议时间两天&一晚)

地址:上海闵行区天山西路4086号

注册费用:3400元/人  按交费先后顺序安排座次,注册费包含会场、教材、午餐、视频课程等费用,不含住宿费。

主办单位:上海莫速乎教育投资有限公司、上海荆麦信息科技中心

报名咨询:王老师  136 2183 4129(微信同号)    msh088@126.com

编辑: 会议君   

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