生物数据生物数据解读与分析实践研习会文件通知解读

作者:   2019-03-27
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  • 会议时间: 2019-04-25至 2019-04-28
  • 会议地点: 广州市
  • 电话:18803978542
  • 传真:暂无
  • 联系人:聂涵
  • Email: nys627@126.com
  • 联系地址:
  • 会议网址:

各事业单位、科研院所:

随着高通量组学技术的蓬勃发展,生物医学已进入大数据时代。借助生物医学多组学、多层次的海量数据,可以从前所未有的广度和深度来研究生物体运行机制,但海量复杂数据带来的挑战同样巨大。由于生物医学数据多呈分散复杂特征,因此常需要深入分析已有数据。在此基础上,以海量数据发掘与解析为主体内容的生物信息学实践技能就成为科研必要手段,如疾病的病因学、临床诊断标志物、作用靶点识别,关键大分子的发现与功能预测,以及遗传调控机制等方面。授课着力于以实际问题为引线,将理论授课与上机实践有机地融为一体,逐步介绍涉及的各项技能,并指导学员将其融会贯通以真正掌握相关的基本方法与常用工具。主讲专家从事本科、研究生教学多年并在二十余期培训会议中取得了极高的教学评价,受到广大学员的一致好评和推崇。会议有关事宜通知如下:

一、时间地点:2019年4月25-28日   广州 港润明悦酒店(时间安排:周四报到 ,周五~周日授课三天)

二、主讲专家:

伦永志,男,教授,博士,博士后,硕士生导师,壶兰学者,福建省高等学校新世纪优秀人才。社会兼职包括中国医检整合联盟常务理事、中国科促会微生态医疗分会常委、莆田市医学会检验医学分会常委等。主讲临床微生物学检验、医学文献检索、生物信息学等课程。主要研究方向为感染性疾病的分子生物学,具体从事重组人丝氨酸蛋白酶抑制因子Hespintor的生物学功能、乙型肝炎病毒DNA聚合酶反式调节作用机制等方面工作。

主持及参与国家、省市等各级科研、教学项目29项。主编专著3部,参编各级教材16部、专著3部。公开发表学术论文122篇,第一作者或通讯作者58篇。科研、教学成果获省市级、校级奖励12项,指导本科生参加国家级、省级、校级比赛获奖8项。已指导硕士研究生8名。

三、注册费用:

3500元(报名费、注册费、资料费、会议费、午餐费等)食宿可统一安排,费用自理。

发票开具类型:培训费、会议费、资料费,授课期间发放纸质邀请函(盖章)和发票。

注:4月10日提前注册并汇款的话优惠200元

四、温故而知新:参加此次实训会的学员,另外赠送一次学习巩固机会,本人可凭有效代表证件,再次免注册费参加相同课程一次;

五、报名方式:

请各单位接此通知后,尽快确定参会人员,认真填写报名回执并传真至:0371-86073066或发E-mail至: nys627@126.com,会务组收到回执后将通知相关报到事宜。

六、课程大纲安排(全部课程均含上机实践):

4月26日上午:

1、NCBI数据库:Gene(参考序列)、Unigene(标准参考序列)、Nucleotide(非参考序列)子数据库。

2、EBI数据库:HGNC(标准全称/缩写识别、转换)、Expression Atlas(表达图谱)子数据库。

下午:

1、基因结构数据库:内含子剪切位点、启动子序列及分析策略、转录因子及其结合位点。

2、蛋白质序列数据库:UniProt数据库。

3、蛋白质相互作用数据库:String数据库。

4、蛋白质三级结构数据库:PDB数据库。

5、功能注释数据库:GO、KEGG数据库。

4月27日上午:

非编码RNA注释、靶点预测、验证靶点、功能及疾病关联等数据库。

1. miRNA:miRBase、TargetScan、miRTarBase、miRPath、miRDB等数据库。

2. lncRNA:NONCODE、LNCipedia、lncRNAdb、LncBase等数据库。

3.circRNA:circBase、starBase、CircInteractome等数据库。

下午:

1、利用GEO2R在线工具筛选获得差异表达基因集,并获得TCGA数据库交集结果。

2、先利用ArrayTools软件处理GEO数据库下载的表达谱数据,再进行聚类分析。

4月28日上午:

1、基因集差异共表达分析策略。

2、利用DAVID在线工具进行基因集功能富集分析(GO MF、BP、CC;KEGG Pathway)。

3、绘制基因集功能富集图/维恩图。

4、基因集相互作用图形化分析。

下午:

1、利用Cytoscape软件进行关联基因注释、分子间相互作用、基因集差异表达、基因集共表达的可视化。

2、可视化结果的保存与输出。

七、联系方式:

联系人:聂涵 188-0397-8542(同微信)   电话/传真:0371-86073066

E-mail:nys627@126.com                       QQ:2628312269

编辑: 会议君   

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