生物信息学实战——Linux基础(6月)

作者:   2019-04-02
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  • 会议时间: 2019-06-24至 2019-06-26
  • 会议地点: 北京
  • 电话:18618295767
  • 传真:暂无
  • 联系人:张老师
  • Email: bcc_peixun@163.com
  • 联系地址:
  • 会议网址:
Linux跟大家熟知的Windows一样,是计算机常用的操作系统之一。目前,大多数的生物信息学软件都是在Linux操作系统上运行的,因此在学习生物信息学之前,Linux操作系统的学习是必不可少的。本课程针对初学者,结合生物信息学分析工作中的实际案例,由浅入深的讲解Linux操作系统的使用及shell编程。课程内容涉及目前在IT领域热门的docker容器技术,实战讲解容器技术在生物信息分析中的应用;课程还涉及高性能计算平台的使用,学员可以实际操作高性能计算平台来感受大数据分析的过程。

培训对象:从事生命科学、医学、农学等领域科研工作者和高校教师及研究生及致力于从事生物信息分析的在校大学生及求职者

授课内容

1、讲授Linux操作系统的发展进程及特点,介绍其在生物信息、IT领域的应用

2、讲授在命令行下使用bash命令进行文件的增删改减操作

3、补充在进程监控、网络等操作系统方面常用的bash命令

4、详细讲解编辑文件内容的高级命令sed的使用

5、详细讲解高级命令awk的使用,及在生物信息数据方面的应用。

6、结合以上讲解的linux命令,讲解常用的命令组合实现复杂的操作

7、讲解linux文件系统的构成,并讲解权限、环境变量的概念

8、讲解Linux自带的Vim文本编辑器的使用,实现在命令行下快捷的编辑文本

9、讲解shell编程的基础语法、数据结构,结合bash命令生成基础shell脚本

10、讲解shell编程的if判断、for循环的语法及练习

11、讲解shell编程的函数语法、变量的概念

12、练习常用的shell脚本,讲授在生物信息分析工作中shell脚本的使用

13、讲解Linux下安装软件,尤其是生物信息学软件的方法,并讲解软件的调用

14、docker作为一种容器技术在生物信息软件安装方面的应用,并讲解docker的基础操作15、简介高性能计算平台的构成及原理,并在计算中心的高性能平台实战操作

16、根据学员在工作学习中的实际问题讲解更多Linux的知识

(详细内容请联系微信 18618295767 索要)

培训特色:

一流的讲师团队--基因组学专家与一线分析人员亲自授课;

全面的课程--技术应用、原理流程、实例联系全贯穿

理论知识与上机操作相结合,为每位学员提供实际操作机会

增值服务,课下主讲老师将为您实际工作中遇到的问题提供个性化解答

小班教学,每期培训班的人数不超过35人。

报名费用:培训费-2800元,含听课费、材料费、上机费。请自带笔记本电脑用以上机实习。材料:《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。食宿自理,酒店自行预定。

报名优惠政策:

1、3人以上团体报名每人可减少300元;

2、4+1团报,可免费赠送一个名额;

3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

联系方式:QQ号:3498448850;张老师 18618295767(微信同号)    邮箱:bcc_peixun@163.com

注:培训前一周前后,会有邮件/电话通知开班与否;如未收到,请电话联系确认。

编辑: 会议君   

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