丁香园基因课 2019 暑期 R 语言与数据表达培训班（40 人精品小班）

作者： 2019-06-20

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会议时间： 2019-07-20至 2019-07-22
会议地点：北京
电话：13033603379
传真：暂无
联系人：陈老师
Email： chenyu1@dxy.cn
联系地址：
会议网址：

由丁香园主办 R 语言与数据表达挖掘专题会议定于 2019 年暑期在北京、广州、杭州、上海召开。通过 3 天的培训可自行完成转录组基本分析以及表达数据的深度挖掘与绘图。

欢迎广大学者、师生参会交流，同时请相关单位转发本会议通知，感谢支持！

会议主题

R 语言与数据表达挖掘专题

会议特色

通过三天的现场教学，帮助学员：

1. 获得比较扎实的 R 语言基础；
2. 能够用 R 语言进行数据分析；
3. 能够使用 ggplot2 绘制常见图形；
4. 掌握 PCA、共表达、聚类、Heatmap、富集、Cytoscape 等分析；
5. 掌握 GEO、TCGA 数据库数据的下载、挖掘。

增值服务

课程所有理论均有现场实操练习
赠送相关生物信息教材赠送 14 门以上视频课程
赠送自动化脚本、流程和测试数据
赠送高性能服务器，免费用一整年
加入 VIP 交流答疑群

会议安排

第一天 9:00～12:00

R 语言基础

1. R语言介绍
2. 快速入门：通过一个例子，30分钟理解编程语言的体系框架
3. 环境部署：R、Rstudio、包的安装
4. 数据类型：数值型、字符型、逻辑型
5. 数据结构：向量、数据框、列表、因子等
6. 流程控制：循环、条件
7. 输入输出

第一天 14:00～18:00

表达数据挖掘原理

1. 表达芯片与转录组测序原理
2. 表达数据挖掘思路串讲，锁定关键基因与锁定关键样本有哪些方法？
3. 差异表达与假设检验，更多生物学重复还是更多数据量？
4. 富集分析，多种富集分析方法，GSEA等？
5. 相关性分析，生物学重复好不好？如何提取表达模式相似的基因？
6. 主成分分析，降低数据维度，简化分析
7. 聚类分析？搞清楚样本关系，将功能相似的基因聚成模块
8. WGCNA：探索模块与性状的关系，肿瘤分期如何作为性状？
9.有哪些其他领域的研究方法可以推广到医学研究中？

第二天 9:00～12:00

表达数据挖掘实操
1. 差异表达分析及火山图绘制
2. 富集分析及图表绘制
3. 相关性分析及绘图
4. 聚类分析与绘图
5. Heatmap 绘图，各种复杂的热图绘制

第二天 14:00～18:00

表达数据挖掘实操

1. 主成分分析与绘图
2. WGCNA，加权共表达分析与绘图
3. Cytoscape 网络图绘图
4. 富集分析，GSEA
5. 生存分析会绘图

第三天 9:00～12:00

GEO 与 TCGA 数据挖掘

1. SRA 数据库介绍
2. GEO 数据库介绍及数据下载和整理
3. TCGA 肿瘤数据库介绍及数据下载和整理
4. GEO、TCGA 分析流程和代码参数讲解（赠送全套流程代码）

第三天 14:00～18:00

Tidyverse：数据处理与ggplot2绘图

1. Ti bble 数据结构介绍，与数据框的转换
2. 使用 tidyr 进行数据变形
3. 使用 dplyr 进行数据处理和统计
4. ggplot2 基本概念：图层、映射、标度、几何对象、统计变换、主题、坐标
5. 绘图实战：散点图、条形图、直方图、箱线图、小提琴图、密度图等
6. 图形美化：主题设置
7. 实用技巧：分面、一页多图等

会议时间

北京 2019/7/20-22

广州 2019/7/27-29

杭州 2019/8/10-12

上海 2019/8/17-19

会场地址请咨询会务组人员。

会议费用

报名费原价 3500 元/人，老学员价 3300 元/人，团体价 3000元/人。

报名费仅包含学习及资料费用，交通、食宿自理。

缴费方式（二选一）：