生命活动的基础是生物分子间以及生物分子与其它分子间的相互作用,主要包括蛋白-蛋白相互作用、蛋白-核酸相互作用等。研究生物分子间的相互作用,可以从分子水平上了解生命现象,从而阐明生命活动的机理,发现致病机制、治疗途径以及新药研发,具有非常重要的理论和现实意义。
随着生物分子相互作用实验技术平台的发展,积累了大量的分子互作实验数据,如何分析和处理这些数据成为关键。目前,用生物信息学的手段来研究生物分子相互作用显示出巨大的优势,技术工具更替升级的速度也越来越快。对从事基础研究的人员来说,迫切需要学习掌握生物信息学,生物分子互作等新工具,才有机会在科研竞争中占居优势。
北京市计算中心生物计算事业部立足于生物分子作用研究的最新技术和工具,特推出“生物分子互作常用软件使用”培训班。我们希望通过本次培训班能让您真正了解到生物分子互作分析能为您的研究带来哪些帮助,带领您了解并掌握几种国际领先的分子互作工具和相关的前沿技术。培训后学员可以获得生物分子互作相关软件的使用和分析能力,大大提高以后的生物方面科研能力。我们期待您的参加!
授课对象:
有生物分子互作分析需求的或者希望深入了解并掌握生物分子互作生物信息学分析数据库及工具的研究生、科研工作者。
学员基础:
由于培训具备一定的深度和广度,我们希望学员应具有学习生物分子互作软件的兴趣、基本的生物概念和相关基础知识。
上机操作:
有,学员需携带笔记本电脑。
时间安排及授课内容:
2019.8.12-14(报名中)上午9:30-12:00,下午13:30-17:00.
一、生物分子互作概述
1. 生物分子相互作用简介;
2. 生物分子相互作用研究技术介绍;
二、生物分子相关数据库
1. 蛋白数据库介绍及应用;
2. 基因数据库的说明及使用;
三、生物分子相关数据库
3. NCBI数据库数据简介与应用;
4. NCBI数据库实例讲解与练习;
四、VMD软件
1. 可视化软件VMD简介;
2. VMD软件的使用;
3. 实例讲解与练习;
五、Vina 软件
1. Vina软件介绍;
2. Vina软件的应用;
3. 实例讲解与练习;
六、Autodock软件
1. Autodock软件原理及功能介绍;
2. 对接文件的准备;
3. 对接;
4.对接结果分析;
5.实例与练习;
七、Pymol软件
1. Pymol软件介绍;
2. Pymol软件的鼠标和命令行使用;
3. 实例讲解与练习;
八、Chemdraw软件
1. Chemdraw软件简介;
2. Chemdraw软件使用;
3. 实例与练习;
九、生物分子相互作用网络分析绘图
1.IPA数据库简介及使用;
2.基于String、DIP等数据库的蛋白质相互作用分析与图形可视化;
3. 利用Cytoscape 绘制生物分子交互作用复杂网络图、生物学通路的方法及技术应用;