课程背景及简介:
传统中药历史悠久,在治疗复杂慢性疾病方面具有独到的疗效和较小的毒副作用。但中药存在成分复杂、机制不清的问题,阻碍了中药的现代化和国际化。中药的物质基础和作用机理,尚需应用现代医学和生物科学技术,进行深入的研究。近年来,将系统生物学的思想和方法应用于中药研究中,正成为一种新的趋势。中药网络药理学已发展成为一个新的交叉学科,它将网络科学、生物信息学、计算机科学和数学等学科的方法结合到中药药理的研究中,从分子水平和分子网络调控的背景中阐明中药的作用机理。通过中药网络药理学的方法,可望使中药的理论研究和临床应用更加科学严谨,逐渐得到世界的认可。
中药网络药理学已成为近年来研究的热点和国家自然基金重点支持的领域,一系列的数据库及计算方法被开发出来。但是,对于临床医生、科研人员和硕博士研究生,尤其是没有生物信息学分析基础、不会编写计算机程序的初学者而言,如何合理地应用这些已有的数据库和计算方法,分析自己所研究的中药方剂,解释实验结果,仍然是一大难题。
本次培训班将邀请长期从事中药网络药理学的研究人员,结合个人实践经验,带领广大学员,从科研设计、项目具体实施以及SCI文章发表等多个方面,通过实际案例,介绍中药网络药理学的研究思路及具体方法。
时间地点:
会议时间:2019年9月7-8日(2天)6日可报到
会议地点:武汉长江大酒店,武汉市硚口区解放大道1131号
主办方:上海遐永医药科技有限公司
酒店安排: 推荐武汉长江大酒店,住宿费用自理,也可自行预订周边酒店大床房和标间价格一致 348元/间。需通过主办方预定。
课程内容、目标与特色:
本次课程以SCI文章为案例主线,逐一详细剖析,全程电脑实战教学。理论与实践相结合,老师将以最简单易懂的方式,既介绍中药网络药理学的研究路线、发展状况和最新前沿进展,又介绍具体的数据库、工具和软件的使用,并在课堂上进行上机指导。本学习班全部采用免费数据库和在线分析工具,学员不需要编写程序。
授课老师:赵老师,多年从事生物信息学及中药网络药理学方面的研究, 发表生物信息学、网络药理学及中药复方相关SCI数十篇,含多篇5分以上的文章,主持多项国家自然基金和省部级科研课题,获得多项省部级科研及教学奖项。讲课效果好,获得学员好评。
参会对象:各级医院临床医生、药师、科研单位研究人员、高校硕/博士研究生、对中药复方和网络药理学感兴趣的广大师生(尤其适合初学者和无基础的学员,无需任何编程基础)。
课程安排;
第一天上午:
网络药理学的发展历程和研究现状简介
中药网络药理学SCI论文的详细剖析
中药网络药理学的核心问题
中药网络药理学的研究路线
第一天下午:
常用中药数据库及使用方法
化合物结构信息的查询
用中药数据库查询化合物靶点
用药靶数据库查询化合物靶点
用化合物结构相似性预测化合物靶点
基于药效团模型预测化合物靶点
用分子对接验证化合物靶点
用数据库查询疾病相关基因
分析GEO数据库中的基因芯片数据,获取疾病相关基因
第二天上午:
基因ID转换
用DAVID进行GO富集、通路富集、tissue富集、疾病基因富集分析用Connectivity Map分析药物机制
基因功能相关网络构建
基因共表达网络构建
第二天下午:
全基因组网络数据获取
Cytoscape软件构建和分析网络:网络构建;基本拓扑特征计算;重要节点识别;网络拓扑指标含义;模块分解;子网络提取;网络可视化;数据输入输出;图形导出;Cytoscape插件的安装和使用等药物影响的子网络的构建
常用图形绘制方法介绍
课程总结