培训简介：
癌症是临床医学中非常重要的疾病方向。TCGA数据库中包含了常见了40种癌症方向（含30000个样本）的高通量数据及临床信息。大家对TCGA数据库的使用近几年也在逐渐增加！
主办方：医药加平台
承办方：上海遐永医药科技有限公司
培训时间：2019年9月7-8日，6日可报到（下午3点-晚上9点）
上课时间：上午9：00-12：00，下午1：30-6：00
培训地点：武汉长江大酒店 武汉市硚口区解放大道1131号推荐住宿武汉长江大酒店，348元/间 住宿自理
培训预期：
1、通过两整天培训，掌握TCGA，GEO数据库的使用、下载及高通量数据分析思路和实用操作知识点。
2、可以独立完成一篇基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。
3、课后赠送1小时全场串联视频，用于学员复习。
4、赠送一份最近5年的高价值国自然标书（医药加高价值标书库里面选择）
5、讲师团队赠送TCGA数据库甲基化、基因表达谱整合分析报告和疾病mRNA+lncRNA分析报告
讲师简介：
宋伟博士成果：参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。研究方向：有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。
课程安排：
周六上午
生物信息介绍
高通量：测序及芯片介绍——多组学：转录组学、基因组学、表观组学、宏基因组学等经典生信SCI文章的思路解读，了解TCGA数据库、GEO数据库及高通量测序数据的挖掘获得创新结论并发文章的思路
TCGA数据库：最全的癌症高通量数据公共库(简介)
TCGA数据库的产生过程
TCGA官方数据库的介绍和使用（包含了转录组、基因组、表观组和临床信息数据）GEO数据库介绍及使用：高通量芯片数据查找、筛选、探针转换、差异分析等。
周六下午
TCGA数据库据下载：RNA-seq数据、miRNA-seq数据、甲基化数据、基因组数据及临床信息数据的下载TCGA数据书库癌症数据的处理，获得关键mRNA、miRNA的表达谱矩阵。
TCGA数据分析——突变分析、差异分析、关联分析、生存分析、miRNA调控靶基因分析等。
获得生存曲线图（KM曲线，分为临床因素和基因表达两种KM曲线）
周日上午
功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析
聚类热图制作
蛋白互作分析（PPI）及网络图构建
网络分析及hub蛋白/基因获得。
周日下午
基于TCGA的lncRNA-miRNA-mRNA全转录组整合分析思路演练
