高通量数据库挖掘与网络图构建分析研讨会

作者： 2019-09-02

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会议时间： 2019-09-19至 2019-09-20
会议地点：上海
电话：18803978542
传真：暂无
联系人：聂涵
Email： nys627@126.com
联系地址：
会议网址：

生物信息学（bioinformatics）定义：是在大分子方面的概念型的生物学，并且使用了信息学的技术，这包括了从应用数学、计算机科学以及统计学等学科衍生而来各种方法，并以此在大尺度上来理解和组织与生物大分子相关的信息。

培训目的：很多老师都做过测序或者芯片实验，虽然测序公司已经给出了一部分的数据分析，比如过滤、质控、比对、定量和差异等，但是这些分析属于基础傻瓜式的标准分析，并不能完整的讲一个故事！因此，需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力，从海量信息中获得自己想要的关键基因！

培训预期：通过2天的培训，使学员掌握生信文献分析思路和8个实用操作知识点（具体见最后），可以独立完成一篇基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。生物信息学魅力：

帮助预测疾病相关的潜在基因，以及该基因潜在的作用靶点、上游调控转录因子等，从而指导实验方向、缩小试验范围、简化试验流程。

为基金申请提供支持，通过强大的信息数据的收集整理，减少投入增强研究目的性；且通过整合技术优势，指导提高临床诊断水平。

丰富的免费的数据资源和生物软件工具：数据库：NCBI, EBI, DDBJ, PDB, SWISS-PROT等；软件工具：Cytoscape，BLAST, R语言，String, David等

讲师简介：宋伟，交大生物信息学博士，参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。

培训经历：在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有：医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。

培训方向：《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等；

培训时间：2019年9月19-20日，18日可报到（下午3点-晚上8点）

培训地点：上海市徐汇区肇嘉浜路500号好望角饭店报到地点：好望角饭店房间价格：经济大床房398元，标间478元，需通过主办方预定

主办方：上海循掘生物科技中心

课程安排：

第一天上午

测序标准报告的解读

NCBI Gene：最权威的基因综合数据库之一。

NCBI GEO：数据量最大的高通量公共数据库。

GEO2R工具：在线做差异分析的R工具

bioDBnet：在线基因ID转换工具。