微生物组学数据分析与挖掘专题培训班

作者:   2019-10-08
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  • 会议时间: 2019-11-13至 2019-11-15
  • 会议地点: 北京
  • 电话:18618295767
  • 传真:暂无
  • 联系人:张老师
  • Email: bcc_peixun@163.com
  • 联系地址:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
  • 会议网址:

微生物存在于世界的各个角落,在医疗健康、环境治理、农业种植、工业生产等诸多领域发挥着举足轻重的作用。近年来,随着测序技术的发展,对于微生物组学的研究持续火热。微生物组学技术现已成为了科研工作者必不可少的研究技术,进而,对其技能要求也是越来越高。尤其是数据库建立、编程语言开发、绘图工具使用技巧及算法模型选择等,已成为广大科研工作者面临的具体问题。

培训内容:

一、微生物组学研究现状及应用

1、微生物组学研究现状及应用
2、微生物组数据分析流程设计
3、常用数据库介绍
4、方案设计与案例分享

二、微生物组学数据分析上机基础

1、Linux常用命令使用和上机操作
2、Linux环境下软件安装

三、微生物多样性数据分析

1、质控流程:双端序列合并、提取barcode、质控、样品拆分、切除引物
2、生成OTU:序列格式转换、去冗余、聚类生成OTU
3、OTU筛选:嵌合体生成原理及去除方法、筛选细菌/真菌序列、生成代表性序列和OUT表
4、物种注释及进化树构建
5、常用Alpha多样性指数计算
6、常用Beta多样性距离矩阵计算
7、统计分析
7.1、箱线图展示Alpha多样性及组间比较统计
7.2、散点图展示样品及组间主坐轴分析(PCA/PCoA/NMDS)
7.3、样品与组间相关分析,并用热图可视化结果

四、宏基因组数据分析与结果解读

1、宏基因组分析基本策略
2、数据质量评估
3、数据质量过滤
4、宿主污染过滤
5、数据组装
6、基因预测
7、物种注释(MEGAN、Krona)
8、功能注释(KEGG、eggNOG)
9、统计分析
聚类分析(物种、功能、基因)
差异分析(物种、功能、基因)
10、常用分析图表在文章中意义和使用场景

五、数据挖掘与可视化实现

1、R绘图功能在微生物组学信息分析中的应用韦恩图、花瓣图、散点图、热图、盒形图(箱线图)等
2、网络分析MENA Igraph Cytoscape
3、物种与样本关系 Circos分析
4、差异物种分析 LEfSe分析
5、KEGG和COG预测分析 PIRUSt和STAMP
6、进化分析 ITOL

报名费用

注册费:3500元/人(含听课费、资料费、上机费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。培训期间,免费提供工作午餐。

付费方式

现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心
账号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里备注上:“生物计算事业部——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称)

报名优惠政策

1、2019.10.29之前报名并缴费的学员每人可优惠200元;
2、3人以上团体报名每人可减少300元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额;
4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

报名联系

QQ号:3498448850
张老师 18618295767(微信同号)
邮箱:bcc_peixun@163.com

编辑: 会议君   

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