微生物组学数据分析与挖掘专题培训班
微生物存在于世界的各个角落，在医疗健康、环境治理、农业种植、工业生产等诸多领域发挥着举足轻重的作用。近年来，随着测序技术的发展，对于微生物组学的研究持续火热。微生物组学技术现已成为了科研工作者必不可少的研究技术，进而，对其技能要求也是越来越高。尤其是数据库建立、编程语言开发、绘图工具使用技巧及算法模型选择等，已成为广大科研工作者面临的具体问题。
举 办 地：北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
课程内容：
2020年2月12-14日上午：9:30-11:30下午：13:30-17:00
一、微生物组学研究现状及应用
1、微生物组学研究现状及应用
2、微生物组数据分析流程设计
3、常用数据库介绍
4、方案设计与案例分享
二、微生物组学数据分析上机基础
1、Linux常用命令使用和上机操作
2、Linux环境下软件安装
三、微生物多样性数据分析
1、质控流程：双端序列合并、提取barcode、质控、样品拆分、切除引物
2、生成OTU：序列格式转换、去冗余、聚类生成OTU
3、OTU筛选：嵌合体生成原理及去除方法、筛选细菌/真菌序列、生成代表性序列和OUT表
4、物种注释及进化树构建
5、常用Alpha多样性指数计算
6、常用Beta多样性距离矩阵计算
7、统计分析
7.1、箱线图展示Alpha多样性及组间比较统计
7.2、散点图展示样品及组间主坐轴分析(PCA/PCoA/NMDS)
7.3、样品与组间相关分析，并用热图可视化结果
四、宏基因组数据分析与结果解读
1、宏基因组分析基本策略
2、数据质量评估
3、数据质量过滤
4、宿主污染过滤
5、数据组装
6、基因预测
7、物种注释（MEGAN、Krona）
8、功能注释（KEGG、eggNOG）
9、统计分析
聚类分析（物种、功能、基因）
差异分析（物种、功能、基因）
10、常用分析图表在文章中意义和使用场景
五、数据挖掘与可视化实现
1、R绘图功能在微生物组学信息分析中的应用
韦恩图、花瓣图、散点图、热图、盒形图（箱线图）等
2、网络分析 MENA IgraphCytoscape
3、物种与样本关系 Circos分析
4、差异物种分析 LEfSe分析
5、KEGG和COG预测分析 PIRUSt和STAMP
6、进化分析 ITOL
【报名费用】
注册费：3500元/人（含听课费、资料费、上机费，请自带笔记本电脑以备上机实践使用）。培训期间，免费提供工作午餐。
【付费方式】
现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称：北京市计算中心
账号：0200151819100023937
开户银行：中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
（汇款信息里备注上：“生物计算事业部——您的姓名”，个人汇款请备注单位名称）
【报名优惠政策】
1、2020.1.10之前报名并缴费的学员每人可优惠200元；
2、3人以上团体报名每人可减少300元；
3、4+1团报，可免费赠送一个名额；
4、上面3种优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。
老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。
培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。
【咨询请联系】
QQ号：3498448850
张老师 18618295767(微信同号）,
邮箱：bcc_peixun@163.com
