单细胞测序数据挖掘与课题设计、基金申请实战会议

作者:   2019-12-17
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  • 会议时间: 2019-12-28至 2019-12-29
  • 会议地点: 北京
  • 电话:13621834129
  • 传真:暂无
  • 联系人:王老师
  • Email: msh088@126.com
  • 联系地址:
  • 会议网址:

在最近三五年内如果去介绍一个科研领域内的热点明星,我会毫不犹豫的推荐单细胞测序。从基金申请热度上来看,目前单细胞话题已经稳居前二,在测序领域单细胞测序的热门程度也逐渐超越了传统的RNAseq和ChIPseq,逐渐成为了新的流量话题王。

2017年10月16日 “人类细胞图谱计划”问世。第一批资助项目总计38个,其中唯一来自中国的是清华大学张学工教授,主要任务是“研究单细胞测序分析的生物信息学全景,为项目的后续发展提供基准参考”,在该项目的推动下单细胞测序热潮更是不断走高。

从09年的第一篇单细胞测序文章到现在10年的时间,单细胞测序的技术,分析算法,科研以及临床应用都取得了非常大的进步。积累的宝贵数据更是十分诱人,单单GEO数据库收录的单细胞研究样本已经近2万例,而且数据的增长呈现明显的指数上升趋势,而且单细胞测序几乎成为非常多CNS优秀文章的标配。但是居高不下的实验及测序成本一直困扰着大部分科研人员,动辄3万+/样,单个课题起码测个6例以上最低投入也接近20万,如果再加上实验失败的样本费用及分析费用预计在30万上下。

那么有没有较低门槛可以介入单细胞测序领域快速发文章的方法呢?

我们邀请到国内第一批做单细胞测试实验室的Dr Wang,为大家专门设计了一门数据挖掘课程,专门针对单细胞转录组测序数据进行「课题设计以及数据挖掘」。数据挖掘类的文章伴随二代测序的发展已经有了趋于成熟的研究策略,但是目前进行传统测序数据挖掘的研究太多,发文的难度也是越来越高。

但是单细胞测序数据的挖掘目前还是处于从零开始的状态,而这座巨大的数据宝库又那么诱人。所以我们在努力争做第一批吃螃蟹的人,从单细胞测序的原理,挖掘思路的寻找,到找数据,到整合分析,再到结果解读以及成文思路,课程都会进行详细的讲解及演示,并提供一套老师写好的高度自动化的分析代码直接产出发表级别的图。争取让学员通过课程能尽可能全面的了解单细胞是什么,能做什么,以及该怎么做。

可能会有学员关心自己关注的课题领域是否有足够的测序数据可供挖掘,目前在公共数据库中的单细胞测序几乎都围绕常见模式生物来做。人,小鼠,斑马鱼等,涉及正常组织、血液、不同发育阶段样本,疾病类型也各种各样包括肿瘤、免疫细胞、炎症类甚至包括较难研究的神经、肌肉、骨骼等。最重要的是,它一直在增加,因此我相信您也一定能参与进来。

课程目标及特色:

1. 编程零基础学员即可参加,用通俗易懂的方式掌握R语言基本语法及做生信分析的技能;

2. 了解单细胞测序的基本概念、原理、主要数据库及下载流程方法;

3. 通过全流程讲解单细胞测序及分析,掌握单细胞挖掘的全流程,及单细胞转录组的发文思路;

4. 通过高度自动化的代码全分享,学会用R软件进行单细胞转录组分析及作图

5. 掌握零成本的单细胞相关课题设计思路,基金申请注意事项,可辅导针对性的课题设计及实操;

6. 通过课程学习可直接接近产出文章,课后讲师定期答疑;

主讲人简介:

Dr Wang,国内最先做单细胞测序的团队成员之一,长期致力于研究高通量测序技术及数据分析,研究方向为单细胞测序技术的研发分析及临床应用,擅长生物信息学的数据挖掘及课题设计,单细胞转录组及多组学数据分析与挖掘。累积发表数据挖掘类SCI文章40+篇,其中10分以上达5篇。参与并完成了包括国家自然科学基金、863计划及国家科技重大专项项目等在内的数10项国家科研项目。

课程安排:

第一天上午

8:30-10:30

生物信息学及单细胞转录组介绍

10:30 - 12:00

单细胞挖掘的基础R语言

第一天下午

13:30 - 15:30

R语言实操练习

15:40 - 17:00

常用单细胞数据库介绍、应用及实操

第二天上午

8:30-12:00单细胞转录组分析全套流程演练及实操(附相关的高度自动化运行代码)

第二天下午

13:30-17:00

单细胞分析实操、案例性解析归纳单细胞的课题设计方法、基金申请注意点

适合人群:医学、生物、农业等专业的各级临床医生、药师、科研单位研究人员、高校硕/博士研究生、对利用单细胞测序或公共数据库研究进行数据挖掘感兴趣的广大师生(尤其适合初学者和无基础的学员,无需任何基础,也无需学习任何编程语言)。

基本信息

时间地点:2019/12/28-29(27日报到)

北京冠京饭店地址:北京市丰台区丰台北路79号,地铁9号线七里庄地铁站店A2口出

注册费用:3400元/人  按交费先后顺序安排座次。注册费包含会场、教材、午餐、视频课程等费用,不含住宿费。

主办单位:上海莫速乎教育投资有限公司、上海荆麦信息科技中心

住宿安排:(不强行规定,可自己预订附近其他酒店) 北京格林豪泰(北京万丰路七里庄地铁站店)  标准间/单间: 320元/晚/间  (含早餐、含宽带)地址:北京丰台区万丰路300号乙院,近小井南路备注:如需代订,会务组统一安排,费用自理,办理住宿时告诉前台是参加此会议即可,住宿费办理住宿时交给酒店前台。住宿费发票将在退房时由酒店开具给您。

报名咨询:王老师  136 2183 4129 (微信同号) msh088@126.com

请来电或者微信联系索取电子Word函件及报名回执表。

编辑: 会议君   

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