微生物存在于世界的各个角落，在医疗健康、环境治理、农业种植、工业生产等诸多领域发挥着举足轻重的作用。近年来，随着测序技术的发展，微生物组学研究持续火热，微生物组学技术已成为微生物研究领域科研工作者必不可少的研究技术，对其技能要求也越来越高。针对广大科研工作者在运用微生物组学技术开展研究工作中面临的问题，计算中心开发了数据库建立、编程语言开发、绘图工具使用技巧及算法模型选择等一系列培训课程，欢迎大家报名参加。
主办单位：北京市计算中心
授课形式：线上直播
课程安排：2020年3月26-4月1日
一、微生物组学研究现状及应用
1、宏基因组测序技术概述
2、宏基因组的研究思路
3、三种宏基因组测序方案
4、常用数据库介绍
二、微生物组学数据分析上机基础
1、Linux常用命令使用和上机操作
2、Linux环境下软件安装
三、微生物多样性数据分析
1、质控流程：双端序列合并、提取barcode、质控、样品拆分、切除引物
2、生成OTU：序列格式转换、去冗余、聚类生成OTU
3、OTU筛选：嵌合体生成原理及去除方法、筛选细菌/真菌序列、生成代表性序列和OUT表
4、物种注释及进化树构建
5、常用Alpha多样性指数计算
6、常用Beta多样性距离矩阵计算
7、统计分析
7.1、Alpha多样性及组间比较统计
7.2、散点图展示样品及组间主坐轴分析(PCA/PCoA/NMDS)
7.3、样品与组间相关分析，并用热图可视化结果
四、宏基因组数据分析（一）
1、宏基因组分析基本策略
2、数据质量评估
3、数据质量过滤
4、宿主污染过滤
5、数据组装
五、宏基因组数据分析（二）
1、基因预测
2、物种注释（MEGAN）
3、功能注释（KEGG、eggNOG）
4、统计分析
聚类分析（物种、功能、基因）
差异分析（物种、功能、基因）
六、数据挖掘与可视化实现（一）
R语言基础及R语言绘图
七、数据挖掘与可视化实现（二）
1、报告解读及常用分析图表在文章中意义
2、R绘图功能在微生物组学信息分析中的应用
韦恩图、花瓣图、散点图、热图、盒形图（箱线图）等
3、OUT/物种相关性分析
Network分析
4、物种与样本关系 Circos分析
八、数据挖掘与可视化实现（三）
1、差异物种分析 LEfSe分析
2、KEGG和COG预测分析
PIRUSt和STAMP
3、进化分析 ITOL
报名费用
注册费：3500元/人（含听课费、上机账号1个、线下课程半价优惠券1张），请自备笔记本电脑上机实践使用。
开具增值税发票，提供盖章通知、结业证书等相关材料。
课程结束后，可将上课期间用到的数据、PPT资料、脚本、视频等相关文档，通过移动硬盘邮寄的方式快递到您手上，便于您后续继续学习使用。
报名优惠政策
1、3人以上团体报名每人可减少300元；
2、4+1团报，可免费赠送一个名额；
3、上面优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种；
老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。
包年优惠价
按年付费，45000元/人。包括报名后1年以内所有线上课程；高性能计算资源基础账号1个，使用期限1年；线下培训名额2个。
付费方式
单位全称：北京市计算中心
账号：0200151819100023937
开户银行：中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
（汇款信息备注：“生物计算——您的姓名”,个人汇款请备注单位名称）
注：款项支出后，请提供付款回执给工作人员，方便核实到账、开具发票。
咨询请联系
QQ号：3498448850
邮箱：bcc_peixun@163.com
张老师 18618295767（微信同号）
于老师 15621925881
【注】开课前三天会发送邮件通知；确认开课后，开课前一天会将直播链接及上机账号发至您邮箱或微信。如未收到，请及时电话咨询。
