无实验无数据没关系，用 R 语言挖掘别人的数据，发表自己的文章
两天一夜高强度实训，讲究实战，所有经验和盘托出
会后赠讲课录像便于反复复习（加密播放不零售，保障学员优势权利）
第十九期 2020/7/11-12 （两天 & 一晚）
第二十期 2020/8/15-16 （两天 & 一晚）
网络精讲班（直播授课，非录播）微信群长期答疑
还在认为没有实验就不能发表论文？还在为不精通挖掘 GEO，TCGA，SEER 的数据库而痛苦不堪？还在为不知道如何找课题找靶点而苦恼？还在为不会那些高大上的图表而暗自伤神？快来参加莫速乎的科研数据挖掘实战专题学习班吧，挖掘别人的数据，发表自己的文章，一次学习，不再报班！
本会议由于带着明确的目的性去学习 R 语言，且针对有/无 R 语言基础的学员均具有很大宽容性，自开班起就广受好评。随着近年来生物信息学技术的普及，R 语言是每个科研工作者都有必要掌握的技能，以往漫无目的的学习 R 效果不理想，用 R 去进行科研数据挖掘，既学习了 R 又解决了实际科研问题。
学完课程并掌握后能干什么：
1. 没有课题的时候找到课题，没有机制的时候挖掘机制
2. 为基金申请保驾护航，发表 paper 如虎添翼
3. 掌握 R 语言的核心技能，GEO，TCGA，SEER 的数据处理没有压力
4. 科研绘图：以一敌百，高端大气，私人订制。
这是一份带有诚意且注重实战的数据挖掘课程。我们的目标是：一次学习，不再报班。
课程特点：
1. 不留秘密，私货全出，全程只用 R 语言，关键步骤不隐藏。
2. 第一天晚上时间充分利用，增加带有讲师指导的练习，更多的训练时间，更好的掌握。
3. 讲最核心的知识，讲通用的技能，适合各个专业。学后可应用到其他数据库的挖掘。
4. 实例操作 (至少 3 个套路)，让你快速掌握数据挖掘套路。
5. 现场完成一篇 paper 的思路以及图表。
6. 讲师阵容强大，内容丰富深入
主讲人简介：果子老师，在生信方面具有丰富经验，本次进行两天一晚的高强度实操训练，目标是让大家一次学习不再报班。讲师已在生信网站及公众号发布上万条生信相关帖子。作为临床科研工作者，深知无课题之苦，因此愿将所学知识和盘托出，没有隐藏。致力于给非生信专业人员普及生物信息学，擅长各种组学的处理，且讲课诙谐幽默。
适合人群：广大临床/科研工作者及心有热血被困囚笼的研究生
课程安排：
第一天
08:30-11:55
R 语言基础知识介绍
R 语言数据结构以及循环控制 (向量，因子，矩阵，数据框，列表,for 循环，if 控制)
编写自己的第一个批量处理数据的程序
R 语言中数据框的操作 (增删改查)
真实数据的清洗和整理
R 包以及 bioconductor 资源的使用
R 包无敌安装攻略 R 语言绘图系统
R 语言的读入以及写出数据
统一午餐
13:30-17:00
使用卡片复习 R 语言基础知识（2 天中重复 4 次）
GEO 数据库成套流程实战（数据清洗，热图，火山图，GO 分析，KEGG 分析，共表达分析）
GEO 数据便捷实用的 GSEA 分析
GEO 芯片的探针 probe 转化方法汇总
多个 GEO 芯片联合分析
TCGA 数据库背景介绍+阅读文献
TCGA 相关的网页工具汇总学习
介绍不同的癌症和不同组学
不同的分析套路解读 (WGCNA，signatures，miRNA-mRNA 配对或者 ceRNA 等)
TCGA 数据分析的软硬件准备
下载及理解 TCGA 数据 (所有数据)
R 制作 TCGA 表型数据临床三线表
17:00-18:00
统一晚餐
晚上
18:00-21:00
R 语言数据框的操作练习 (掌握 tidyr 和 dplyr)
如何根据需求绘制一个漂亮的火山图 (学习 ggplot2)
使用 R 语言制作特定肿瘤所有基因表达的数据库
TCGA 原始数据的下载（GDC 的方法和 R 包方法）
任意癌症任意基因在癌和癌旁的表达
如果有亚型，在不同亚型中的表达
如果有肿瘤有分期，在不同临床分期中的表达
单个基因在多个正常组织中的表达
单个基因在多个细胞系中的表达
单个基因在多个肿瘤中的表达
两个基因的相关性如何分析
第二天
08:30-11:55
差异分析 (从 counts 数据开始整理表达数据，表达矩阵归一化，DESeq2)
提取 mRNA 矩阵
提取 IncRNA 矩阵
提取 MiRNA 矩阵
ceRNA 网络构建
单基因的 GSEA 分析
神技能：注释任何一个基因包括长链非编码 RNA
使用多种统计算法定位 signatures cox,lasso 回归
生存分析
绘图美化
任意癌症中任意基因的生存分析
任意癌症中批量生存分析
TCGA 文章的框架分析以及复现
答疑环节
统一午餐
13:00-16:30
利用 GEO 和 TCGA 数据库找到课题
利用 GEO 和 TCGA 数据库发掘下游机制
如何利用 GEO 和 TCGA 数据库申请基金
如何利用 GEO 和 TCGA 数据库发表文章
现场完成一篇生信文章的所有图表
提出科研假设
根据科研假设下载整理数据导入 R 语言
在 R 语言中清洗和整理数据达到对应 R 包的要求
数据处理过程中调整分析策略
绘制各个部分需要的图标
时间地点：
第十九期 2020/7/11-12 （会议时间两天 & 一晚）
第二十期 2020/8/15-16 （会议时间两天 & 一晚）
报名付费成功后，课前发培训需要应用到的软件与安装包，并且指导安装
注册费用：3400 元/人
两天集中网络授课，互动性好；
可开具会务，数据分析等发票；
可回放，可免费复听；
参加培训的学员可通过微信群继续和老师交流，长期获得答疑机会；
如果本次没学会，以后还可免费参加本班（疫情过后可免费参加线下培训）。
主办单位：上海莫速乎教育投资有限公司、上海荆麦信息科技中心
报名咨询：王老师 136 2183 4129（微信同号） msh088@126.com
请来电或者微信联系索取电子函件及报名回执表。
