重测序专题研讨班通知——实用生物信息学系列专题班通过全基因组重测序的序列比对,研究者可以找到大量的单核苷酸多态性位点(SNP)、拷贝数变异(CNV)、插入缺失(InDel)、结构变异(SV)等变异位点。并通过对已知全基因组序列的物种进行测序,来研究个体或群体间的相关变异信息,从而找出与疾病、性状、以及功能有关的基因,进行个体或群体分子水平的差异分析。随着测序成本的大幅度降低以及测序效率的数量级提升,再加上已知基因组序列的物种增多,全基因组重测序已成为动植物物种遗传差异研究、功能基因挖掘等最可靠的方法。为了更好的服务于广大科研工作者的需要,北京市计算中心生物计算事业部举办“重测序”专题研讨班。每期名额有限,欢迎您参加!
主办单位:北京市计算中心
培训地点:北京海淀区丰贤中路7号3号楼,北京市计算中心三层会议室
培训时间: 2014年5月21-23日
本次课程时间:
上午:9:30-11:30
下午:13:30-16:30
授课题目授课内容
重测序研究背景及理论
生物信息学知识背景概述;
二代测序的基本概况和技术发展简介;
重测序的基本概念、研究历史、内容和意义;
重测序研究策略以及技术、前沿热点及趋势;Linux上机操作及生物信息学软件安装
linux基础基本操作;
生物信息学软件应用及常用软件介绍、重测序相关分析软件介绍及安装;动物、植物、微生物重测序的案例分析应用及分析流程
动物重测序理论与案例分析;
植物重测序理论与案例分析;
微生物重测序理论与案例分析;重测序分析上机练习
重测序的分析流程;
原始测序数据的质控及过滤;
学习bwa,samtools,pindel等工具的使用,进行calling SNP、INDEL、SV,变异注释及功能分析;重测序(外显子组测序)在群体遗传学中的应用
群体遗传学理论、进化分析;
GWAS分析;群体水平测序数据分析实例
混池重测序的进化分析流程
孟德尔疾病的外显子组测序分析流程;
低覆盖度重测序与缺失基因型填充(Imputation)分析流程;
复杂疾病的重测序GWAS分析流程。(课程内容以实际授课为准)
【报名费用】
注册费:工作人员3000元/人、学生2500元/人,主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。
【付费方式】
现金、支票、银行转账、银行汇款单位全称:北京市计算中心
账号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”,个人汇款请备注上单位名称)
【报名优惠政策】
1、3.1日前预报名的学员每人可优惠400元,开课前20天报名的学员每人可减少200元,开课前10天报名的学员每人可减少100元。
2、2人团报每人可减免200元,3人以上团体报名每人可减少400元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额
4、上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
5、老学员、老学员介绍的学员均可以再优惠200元。培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。请联系:王老师 021-36310677, 邮箱:346517520@qq.com