Python语言培训(零基础初级班)

作者:   2014-06-07
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  • 会议时间: 2014-06-22至 2014-06-24
  • 会议地点: 北京
  • 电话:021-36310677
  • 传真:
  • 联系人:王老师
  • Email: shqk2012@163.com
  • 联系地址:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
  • 会议网址:


Python是一种解释型、面向对象、动态数据类型的高级程序设计语言。由于Python语言的简洁、易读以及可扩展性,在国内外用Python做科学计算的研究机构日益增多,在生物信息学和医学领域已经有大量程序软件全部或部分使用Python来设计。Python的使用率呈线性增长,已经成为最受欢迎的程序设计语言之一。Python目前拥有很多专用的科学计算扩展库,例如十分经典的科学计算扩展库NumPy、SciPy和生物信息学专用的Biopython,它们分别为Python提供了快速数组处理、数值运算以及绘图功能,还有专门的生物信息学处理分析功能。因此Python语言十分适合工程技术、科研人员处理实验数据、制作图表,甚至开发科学计算应用程序。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生物学、医学、农学等人员开展了此培训,帮助大家快速开展生物信息数据各项分析。欢迎您报名参加!

主办单位:北京市计算中心,生物计算事业部

举办地:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

培训时间:2014.6.21-6.24日

培训内容及安排:

日期

时间

授课题目

授课内容

第一天

09:30-10:30

Python概述及其在生物信息领域的应用

概括介绍Python语言的概念及特点,及其在生物信息领域的应用

10:30-12:00

Python软件安装、运行与基本操作

Python及iPython的安装及使用,Python程序的运行;DOS、Unix命令行操作基本命令;Python变量定义、数字及基本运算

13:30-15:00

核心数据类型(1)

列表、元组

13:30-16:00

基本语法结构

判断结构、循环结构、异常处理

16:00-17:00

实例练习

使用python编程,生成斐波那契数字序列

第二天

09:30-11:00

核心数据类型(2)

字符串、字典

11:00-13:00

文件与文件夹操作

文件的读入与写入、文件夹操作

13:30-17:00

实例练习

FASTA文件的处理:1、序列基本信息的统计;2、序列反转和切割

第三天

09:30-11:00

函数和模块

系统库函数、第三方函数、自定义函数;模块定义、导入、使用

11:00-12:00

正则表达式

Python特色功能正则表达式学习与应用

13:30-14:30

实例练习

系统命令在python中的调用

14:30-17:00

实例练习

大数据文件的分割及合并

第四天

09:30-11:00

BioPython简介及应用实例

BioPython安装及学习,生物信息学中的实际应用

11:00-12:00

BioPython快速应用

使用BioPython处理传统的生物信息数据

15:00-17:00

实例练习

应用biopython实现genbank、uniprot格式数据转换为fasta格式。

应用biopython在blast xml结果文件中提取目的信息。

授课实例

1.       大数据文件分割。

2.       系统命令在python程序中的调用。

3.       fasta文件中序列基本信息统计:序列数、碱基数、及平均长度。

4.       生物信息学二代测序数据质量控制及预处理。(选学)

5.       fasta序列反向互补转换。

6.       应用biopython实现genbank、uniprot格式数据转换为fasta格式。

7.       应用biopython在blast xml结果文件中提取目的信息。

8.       多样品混合测序,根据标签序列barcode对原始测序数据进行分样。(选学)

(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)

培训特色

1、对口生物信息;    2、非严格语法,适合初学;

3、功能强大、跨平台;4、灵活易用

报名费用  注册费:3200元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。

付费方式现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称:北京市计算中心      账号:0200151819100023937 

开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”)

报名优惠政策

1、2014年5月15日前报名,可优惠200元。

2、2人团报每人可减免200元,3人以上团体报名每人可减少400元;

3、4+1团报,可免费赠送一个名额

4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

5、老学员、老学员介绍的学员均可以再优惠200元。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

注意事项

  1. 已经成功付款的学员,如在开课前7个工作日前联系主办方撤销席位,可退还100%的注册费用;如在开课前3个工作日内(含3个工作日)要求撤销席位则退还80%的注册费用。

  2. 撤销席位后,学员可提交延期申请,可参加当前时间到2014.12.12日期间由北京市计算中心举办的各类培训,费用将采取多退少补原则。逾期不参加任何培训课程可申请退款,退款期间产生的所有费用由学员本人承担

    联系咨询

    上海联络处:王老师 021-36310677  13621784306  邮箱:shqk2012@163.com

报名回执表:

培训班类型:(可多选)

□实用生物信息学培训班       □科研论文绘图培训

□宏基因组分析专题研讨班      □python语言专题班

姓名:

 

性别

 

民族:

 

职称:

 

身份证号

 

工作单位:

 

住宿:

是□;否□

研究方向:

 

报名时间:

 

通讯地址:

 

邮编:

 

固定电话:

 

手机:

 

E-mail:

 

报名种类:

A□           B□             (该选项仅报名生物信息培训班人员填写)

对课程了解情况

☆☆☆☆☆

感兴趣的课程:

 

信息渠道:

□中心主页 □邮件宣传(张利英、员丽丽)□海报 □单页 □销售员  □丁香园  □生物论坛  □生物通邮件、主页  □朋友推荐               

发票抬头:

 

发票内容:

 

住宿明细

入住时间:

离店时间:

房间类型

□大床间

□标准间(和       合住)

□拼房(与其他学员拼标准间)

备注:

 

                                   

确定报名后,请将回执表发到上述联系人邮箱里。如在两日内没有收到回复,请电话联系确认:021-36310677  谢谢。

编辑: meeting201   

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