各高等院校及科研院所、企事业单位：
表观遗传学是研究基因在核苷酸序列不发生改变的情况下，基因表达可遗传变化的一门遗传学分支学科。目前，已知的表观遗传现象有DNA甲基化基因组印记母体效基因沉默RNA编辑 等。DNA（主要是CpG的）甲基化是其遗传机制和表型效应最为明确的表观遗传性机制。表观遗传学的研究已成为基因组测序后的人类基因组重大研究方向之一。这一飞速发展的科学领域从分子水平揭示了复杂的生物学现象，为解开人类和其他生物的生命奥秘、造福人类健康带来了新希望。
为了提高从业人员的技术水平，应广大行业工作者的要求。培训班采用理论和演示相结合的教学形式，同时学员与授课专家进行现场交流与咨询，探讨学员在平时工作、研究中的瓶颈问题。与同行交流以拓宽自己的研究思路，共同探讨和挖掘表观遗传学资源的科学研究价值和应用前景，我单位将于2021年12月17日--2021年12月20日举办“表观遗传学与数据分析培训班”暨生物信息工程师（高级）实战培训班，中科院及高校权威专家主讲，具体通知如下，欢迎广大相关企事业单位科技工作者，核心技术人员踊跃报名参加！
主办单位：北京中科云畅应用技术研究院
指导单位：中国电子学会（国家专业人员继续教育基地）
一、时间地点： 2021年12月17日--2021年12月20日
南京（线上、线下同时进行）
（第一天报道，授课三天）
二、培训费用：
A 类： ¥RMB:3600 元/人，（包含报名费、培训费、资料费、证书费、午餐费）食宿可统一安排，费用自理。学员经培训考试合格后可以获得：由北京中科云畅应用技术研究院颁发的结业证书。
B 类： ¥RMB:3900 元/人,（包含报名费、培训费、资料费、证书费、午餐费）食宿可统一安排，费用自理。培训结束经考核合格，可获得由中国电子学会颁发全国生物信息人才能力提升工程专业技术证书， 依据人力资源与社会保障部《国家级专业技术人员继续教育基地管理办法》（人社厅发〔2013〕53 号）的要求，本次学习情况，本次学习情况可计入继续教育学时并作为对专业技术人员考核评价、岗位聘用、职称评聘和执业注册的重要依据。须提交电子版彩色照片，身份证复印件。
课程内容及日程安排
第一天上午
表观遗传学研究内容及思路，DNA甲基化原理、应用及研究
1. 表观遗传学研究内容及调控机制。
2. 通过近期Cell文章掌握表观多组学研究思路。
3. 高通量测序技术概述。
4. 表观遗传学各组学测序技术及分析内容。
5. DNA甲基化理论：作用机制及研究应用。
理论
第一天下午
Linux及R语言实操， DNA甲基化数据分析
1. 常规基础Linux命令入门讲解及实操训练。
2. R语言简介及安装，RStudio的安装及使用说明。
3. R语言语法介绍及常用命令。
4. DNA甲基化测序数据分析（bismark， methylKit等软件）。
5. DNA甲基化芯片数据分析（IMA等软件）。
实操
第二天上午
组蛋白修饰及ATAC测序技术、分析思路及流程
1. 组蛋白修饰和ATAC的研究方法及技术发展。
2. 组蛋白修饰和ATAC的研究内容及科研思路。
3. 组蛋白修饰及ATAC数据的分析流程及绘图。
4. 组蛋白和多组学数据的整合分析。
理论
第二天下午
组蛋白修饰及ATAC数据分析
1. 利用fastqc、cutadapt及Trimmomatic对原始数据进行质控。
2. 通过bowtie2、bwa等软件进行基因组mapping。
3. 通过MACS2软件进行peak calling。
4. 利用HOMER软件进行peak注释及motif分析。
5. 调用R语言包Diffbind进行差异peaks分析。
实操
第三天上午
非编码RNA、表观转录组研究内容及思路
1. 转录组数据分析内容及思路介绍。
2. 长非编码RNA、microRNA及circRNA的研究方法及思路。
3. 转录组多组学整合分析思路和案例介绍。
4. 表观转录组学研究内容及多组学整合思路。
5. 组学分析常用数据库介绍及使用。
理论
第三天下午
mRNA及非编码转录组分析：定量、差异、功能富集及网络
1. 通过tophat2、hisat2软件进行转录组数据mapping。
2. 通过HTSeq及featureCounts进行基因表达定量。
3. 通过Deseq2，edgeR等R语言包进行差异表达分析。
4. 应用DAVID及metascape网站进行通路富集分析。
5. 箱型图，热图，网络图，GO、KEGG富集图，GSEA等图形绘制。
实操
三、培训对象：大中专院校生物信息、生物计算、生命科学、医学、化学、农学、计算机科学、数学类专业的课程负责人、一线教师、教研室骨干人员、教学管理人员；科研单位从事生物、生命科学、微生物研究的相关人员；生物、医药、化学及相关企业的领导与技术骨干。
四、主讲专家：中科院的高级专家长期从事单细胞及表观组学等测序技术及分析方法开发、调控机制解析及人工智能应用有丰富的科研及工程技术经验，发表Nature, Nature Cell Biology, MolecularCell 等杂志 40 多篇。具有资深的技术底蕴和专业背景，目前承担国家科技部、国家自然基金委和市科技新星项目等多项课题。
五、报名注意事项：
（一）须具备一定的生物信息学理论及技术基础。
（二）须提交1寸蓝底或白底电子版（100K-200K）照片。
（三）参加线上直播的学员，学员本人可参加一次相同内容线下培训活动，除往返交通食宿外，不再收取其他任何费用。
（四）优秀学员可申请加入中国电子学会“国家级专业技术人员继续教育基地”专家库，优秀作品可在“全国生物信息人才能力提升工程”平台展示。
（五）报名回执表请各院校及科研院所将参会人员报名表填好发送至会务处。开票项目：（培训费、会议费任选其一）
（六）报名咨询
会务组：刘老师 报名电话：15801618831
