micoRNA的研究与流式技术
MicroRNA的概念和功能
MicroRNA(miRNA)是长约20~24nt的单链RNA,它通过与靶mRNA完全或不完全的互补配对,促进目标mRNA降解或抑制蛋白翻译,在细胞增殖、分化、凋亡、基因调控及疾病的发生中扮演重要的角色。
流式分析miRNA的调控作用
通过流式分析蛋白表达情况反映miRNA的调控
摘自:MicroRNA profiling identifies miR-34a and miR-21 and their target genes JAG1 and WNT1 in the coordinate regulation of dendritic cell differentiation
Sara T. Hashimi, Jennifer A. Fulcher et al. BLOOD, 9 JULY 2009 VOLUME 114, NUMBER 2
研究目的:研究miRNA-蛋白网络调控人MDDC分化
技术路线:
图释:使用FACSCalibur进行MDDC的分析研究,发现MDDC的miRNA的表达有阶段特异的表现。图(a)为流式细胞仪分析结果,显示了MDDC分化过程中的细胞表型变化。单核细胞和DC细胞用CD14和DC-SIGN的表达不同来加以区分。图示为3号供者的流式分析图。图(d)显示了细胞miRNA分析的统计学显著差异的等级图(p<0.05)。粗体字代表miRNA上调。下划线代表miRNA下调。其余的miRNA变化呈正弦曲线变化。顶部代表不同时间点的关系,每一列代表一个独立供者样本在某一特定时刻的表现。颜色代表miRNA表达的对数级强度。
流式分选细胞后miRNA分析
通过流式分选出目的细胞后进行miRNA分析
摘自:Downregulation of miRNA-200c Links Breast Cancer Stem Cells with Normal Stem Cells
Yohei Shimono, Maider Zabala et al. Cell 138, 592-603, August 7, 2009
图释:使用FACSAria分析乳腺癌干细胞,分选细胞后进行miRNA的比较分析。图中显示的是CD45-CD31-CD140a-Ter119-细胞的CD24和CD49f的表达情况。MRU是乳腺癌干细胞。MaCFC是祖细胞,它们在体内实验中不能形成乳腺腺管。
编辑: gaowei2010