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DNA甲基化作为肿瘤生物标志物
目前对于早期肿瘤患者,通过靶向治疗等手段,可以显著延长其寿命,但对于晚期恶性肿瘤患者,并无行之有效的治疗手段。因此,肿瘤的早期诊断、分型成为肿瘤预付、治疗的关键。DNA甲基化目前已成为多种肿瘤诊断和预后的生物标志物。
DNA甲基化(DNA methylation)是指在DNA甲基化转移酶(DNMT)催化下,以S-腺苷甲硫氨酸为甲基供体,将活性甲基转移至DNA链中特定碱基上的化学修饰过程。哺乳动物基因组中,DNA甲基化多发生在CpG二核苷酸中的胞嘧啶的5位碳原子。DNA甲基化是一种表观(epigenetic)修饰,它在不改变DNA序列的情况下,对个体的生长、发育、基因表达模式以及基因组的稳定性起到重要的调控作用。
DNA甲基化在肿瘤中的作用主要表现在以下几个方面:一是甲基化的CpG岛二核苷酸中的胞嘧啶以较高的频率脱氨基变成胸腺嘧啶,造成基因突变;二是抑癌基因和DNA修复基因由于超甲基化而沉默;三是癌基因甲基化水平降低而活化;四是基因组总体甲基化水平降低使转座子、重复序列活化导致染色体稳定性下降。这些因素是导致肿瘤发展、转移、恶化最终导致患者死亡的重要原因。DNA总体甲基化水平(即甲基化谱)和特定基因甲基化程度改变可作为肿瘤诊断指标。
RNA和蛋白质是目前研究最多的两类生物标志物,miRNA也被认为可用于肿瘤的诊断分型,但RNA和蛋白质与DNA相比其稳定性差,分离纯化也相对困难,并且此类生物标志物用于定性分析易受到样本遗传背景的干扰。作为肿瘤标志物,DNA甲基化检测比其他DNA标记(如基因突变等)检测更为有效,因为DNA甲基化程度往往在肿瘤早期即已发生变化,因而可用于肿瘤的早期诊断。并且甲基化程度检测不仅可以定性,还可以进行定量。
理想的生物标志物应该可以满足疾病的无损伤监测、检测。现有研究表明,某些肿瘤疾病,DNA甲基化谱在体液(血清、血浆、痰液、尿液等)与病灶处表现吻合,因而采用DNA甲基化检测,也可实现肿瘤的体外无创检测。
编辑: gaowei2010