丁香园 | 丁香通 | 人才 | 会议 | 药学 | 博客  
 点击次数:

罗氏454高通量测序平台

转载请注明来自丁香园
发布日期:2011-08-12 16:29 文章来源:丁香园
分享到: 收藏夹 新浪微博 腾讯微博 开心网 豆瓣社区 人人网
关键词: 专题 高通量 测序 生物   点击次数:

技术优势

1. Titanium 系列试剂提升整体性能

GS FLX测序仪应用升级后的Titanium系列试剂,突破性地实现了第二代测序既确保了每个序列的高质量、高读长,又兼顾了高通量测序的特性。应用广泛而稳定,在基因组de novo测序、基因组重测序、目标基因捕获测序、宏基因组测序和RNA测序分析等研究领域发表了上千篇学术论文。

2. 获得更全面的数据

每次运行能产生100万条以上的有效序列,以Q20为评判标准,单序列读长在400bp以上,只需耗时10h。

3. 提升项目实施能力

应用GS FLX平台可以在一次实验中实现长序列读长测序和大片段双末端测序的完美结合,一次性实验即可完成一个微生物基因组的de novo测序项目,且能确保最佳拼接效果。

4. 降低实验成本

400bp以上的读长和超高通量测序能力,使实验效果最大化,实验成本最小化,并可根据实验设计要求灵活选择测序通量。

5. 提高实验效率

标准化流水作业的文库构建流程,无需进行常规实验中的细菌转化、培养以及单克隆的挑选,emPCR富集全自动工作站大大提高了工作效率。

6. 提供简单易用的生物信息处理软件

提供生物信息解决方案,如GS De Novo Assembler,GS Reference Mapper,and GS Amplicon Variant Analyzer,使测序数据的处理得心应手。

系统属性

Titanium 系列试剂在试剂、耗材和软件方面都进行了优化,确保了GS FLX卓越的测序性能。

1. 测序通量:每次实验可以产生400~600Mb数据。

2. 运行时间:每次实验只需10h。

3. 序列读长:单条序列的平均读长在400bp以上。

4. 序列质量:单碱基准确率为99%。

5. 序列产量:每次实验可以产生100万条以上的序列。

结果展示

仪器剖析

                                                         测序仪全貌                     测序仪内部构造

技术升级

2011年GS FLX Titanium系列试剂将进行升级,测序读长能提高到1000bp,超过了ABI3730XL的测序读长,极大拓宽了GS FLX的应用范围。

1. 1Kb读长结合20Kb、8Kb和3Kb Paired-End测序,可以轻松实现基因组de novo

的完整测序。

2. 在进行转录本测序时,1Kb读长序列可以测通更多的外显子和可变剪接区域,发现更多基因亚型信息。

3. 长序列可以关联距离更远的变异信息,更有利于分型分析。

 

编辑: helen

以下网友留言只代表网友个人观点,不代表网站观点