抗体芯片VS western blot
抗体芯片技术与Western Blot等技术的比较(Proteomics Clinical Applications 2009)
美国NIS与NIH的研究者对于信号通路抗体芯片技术进行了探索与评价,研究者选用了HepG2细胞模型,采用胰岛素干预的方法,使用抗体芯片、Luminex悬浮芯片技术以及Western Blot的方法对干预后胰岛素信号通路的磷酸化水平进行了检测,并对结果进行了比较与评价。
研究中采用的不同技术具有以下特点:
♦ 胰岛素受体信号通路抗体芯片,包括97种抗体,识别大约24种蛋白的43个磷酸化位点;
♦ 悬浮芯片Luminex,包括7种抗体,其中6种识别磷酸化位点,1种为GAPDH抗体,作为内参;
♦ Western Blot,使用7种抗体,可检测4种磷酸化位点。
主要结果如下:
Luminex | FMB Array | |||||
Insulin | PMA | PMA+Insulin | Insulin | PMA | PMA+Insulin | |
Akt (Ser473) | 1.21 | 1.17 | 1.07 | 2.03 | 1.37 | 1.24 |
FOXO1a (Ser256) | 1.23 | 1.17 | 1.17 | 1.35 | 0.84 | 0.87 |
IRS-1 (Ser307) | 0.47 | 1.47 | 1.1 | 0.81 | 2.73 | 1.63 |
p44/42 MAP Kinase (Thr202) | 1.23 | 1.13 | 1.13 | 1.51 | 0.72 | 1.03 |
NFkB-p65 (Ser536) | 0.48 | 1.5 | 1.08 | 0.42 | 0.92 | 0.96 |
Raf1 (Ser259) | 1.67 | 1.11 | 1.21 | 2.09 | 1.18 | 1.48 |
悬浮芯片平台、Western blot检测到的位点磷酸化水平调变趋势与抗体芯片检测的结果一致,例如Akt (Ser473)、IRS-1 (Ser307) 、Raf1 (Ser259)、FOXO1a。
抗体芯片技术是一种高通量的手段,相比较于以往的手段WB,能够获得更多的信息,发现一些蛋白可能的新功能,例如这篇文献,作者发现了HSP27与PTEN可能与佛博酯引起的胰岛素抵抗有关。
编辑: helen