动植物基因组重测序
在已知物种基因组的情况下，对物种内的不同个体或某个个体的不同组织进行基因组重测序，可以在全基因组水平上发现不同个体或组织细胞之间的差异。通过这种方法，可以寻找出大量的单核苷酸多态性位点（SNP），插入缺失位点（InDel，Insertion Deletion），结构变异位点（SV，Structure Variation），拷贝数变异（Copy Number Variation，CNV）等变异信息，从而获得生物群体的遗传特征。这对在群体水平上研究物种的进化历史、环境适应性、自然选择等方面具有重大意义。利用全基因组重测序有助于快速发现与动植物重要性状相关的遗传变异，缩短分子育种的实验周期；有助于发现人类疾病相关的重要变异基因，加快生物医药研发的速度等。可以预期随着测序成本的进一步降低以及已知全基因组序列物种的增加，重测序必将成为生命科学领域的研究利器。
技术路线
提取基因组DNA后采用物理方法随机打断，选择性回收目的片段并在两端连接接头以构建测序文库，进行桥式PCR（Bridge Amplification）制备Cluster，最后使用Illumina测序平台进行双末端测序（Paired-End，PE）。PE测序技术的作用：① 提供足够的测序序列信息；② 挖掘基因组大片段结构变异信息；③ 减少重复序列对基因组组装的影响。
生物信息分析
1. 原始数据统计
2. 短序列mapping至参考基因组
3. 分析mapping区域reads的覆盖度、重复性、覆盖碱基的质量及reads方向
4. SNPs、InDel、CNVs检测
5. 结构变异（SVs）和基因组重排事件分析
实验周期
美吉生物从获得合作伙伴样品、高通量测序到数据分析，一般控制在30到40个工作日内完成。
送样要求
1. DNA样品：浓度≥30ng/μl，总量≥50μg，OD值介于1.8～2.0之间，样品浓度越高越好。
2. 植物样品：需要黑暗无菌条件下培养的黄化苗、组培样品或嫩苗。
3. 动物样品：应挑选肌肉、血等脂肪含量较少的组织进行取样。为了减少个体差异对后续生物信息分析产生的影响，应尽量从同一个体中取样，若物种体积较小，从一个个体提取的DNA量不够进行一次测序反应，在保证量的情况下，应尽量减少个体的个数。
4. 请填写完整的送样订单，用自封袋密封后随同样品一起送样。
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编辑: helen
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