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内参
内参在生物学研究中非常常见。例如RT-PCR或western blot实验中常用表达量稳定的管家基因/蛋白作为评估不同样本之间目标基因或蛋白变化的参考。以western blot为例,如果加药处理前后GAPDH或tublin、actin等基本没有变化,而目标蛋白表达变化明显,则说明“加药”过程中目标蛋白的表达受到影响。内参的引入可以排除上样量不同或样本处理过程中的偏差导致的可能误差···
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microRNA与化疗
化疗是目前治疗肿瘤的主要手段之一,目前发展的化疗药物已经超过50种,例如表阿霉素、柔红霉素、顺铂、5-氟脲嘧啶脱氧核等都是常用的俄化疗药物。但目前常用的大多数化疗药并非靶向药物,因而治疗剂量较大、毒副作用明显。且应用化疗药物一段时间之后可能产生耐受。如何增加癌细胞对化疗的敏感性,减少耐受甚至杀灭已经发生耐受的肿瘤细胞,是肿瘤治疗中的一个重要问题。
MicroRNAs(miRNAs)是一类进化上高度保守的单链RNA,通常长度在22nt左右。胞浆中成熟的miRNA与多种蛋白共同形成miRNA诱导的沉默复合体(miRNA-induced silencing complex, miRICS)结合于靶mRNA的3’-UTR区域,阻遏翻译甚至直接降解mRNA,抑制基因表达。多种miRNA参与在肿瘤发生和发展。研究显示,不少miRNA可能影响肿瘤对化疗的敏感性,有的miRNA可能增加肿瘤化疗敏感性,而另一些则作用相反。
可能增加肿瘤化疗敏感性miRNA 一些miRNA可能增加肿瘤的化疗敏感性(表1),将这些miRNA导入肿瘤细胞,化疗诱导的细胞死亡增加;或者抑制miRNA的表达,化疗诱导的细胞死亡则减少。这些miRNA大部分是报道过的肿瘤抑制miRNA(TSmiRs)。
表1 可能增加肿瘤化疗敏感性的miRNA
肿瘤细胞 | miRNA | 化疗药物 | 靶基因 |
肺癌 | miR-1 | Doxorubicine | MET, Pim-1 |
| miR-16 | NSC236613, NSC670550 |
|
| miR-21 | NSC63878, NSC265450 |
|
胃癌(多药耐药) | miR-15b,miR-16 | Vincristine, adriamycin, cisplatin, ateposide | BCL2 |
前列腺癌 | miR-34a | Camtothecin | SIRT-1 |
胃癌(p53突变,Bcl2高表达) | miR34a,miR43b,miR34c | Doxorubicine, cisplatin, gemcitabine, docetaxel | Bcl-2, Notch, HMGA2 |
胃癌(顺铂耐受) | miR-200c | Cisplatin, ψ5-FU, paclitaxel, adriamycin | E-cadherin |
肝癌 | miR-101 | Etoposide, curcumin, doxorubicine | Mcl-1 |
| miR-199a-3p | Doxorubicine | mTOR, c-Met |
| miR-122 |
| Cyclin G1 |
乳腺癌(doxorubibine耐受) | miR-451 | Doxorubicine | Mdr1 |
乳腺癌 | miR-200b |
| Ferritin |
乳腺癌(VP-16耐受) | miR-326 | Doxorubicine, VP-16 | MRP-1 |
恶性胶质瘤 | miR-451 | Imitanib | SMAD3, SMAD4 |
| miR-21 | NSC123127 |
|
白血病(doxorubicine耐受) | miR-331-5p,miR27a | Doxorubcin | P-glycoprotein |
白血病(长春新碱诱导的多药耐药) | miR-138 | Vincristine, adriamycin, cisplatin, 5-FU | P-glycoprotein, MDR1, BCL2 |
小细胞肺癌 | miR-134 ,miR-379 miR-495 | Cisplatin, Etoposide,Doxorubicin | MRP1/ABCC1 |
卵巢癌 | miR-21 | NSC265450 |
|
| Let-7i | Cisplatin | H-RAS, HMGA2 |
可能导致肿瘤化疗耐受的miRNA 与上述miRNA相反,另一些miRNA可能导致肿瘤细胞耐受化疗(表2),将这些miRNA导入肿瘤细胞,化疗诱导的细胞死亡减少;或者抑制miRNA的表达,化疗诱导的细胞死亡反而增加。有趣的是,一些miRNA在不同肿瘤中作用并不尽相同,例如Let-7i,抑制其在卵巢癌中细胞中的表达,细胞对顺铂诱导的细胞死亡变得不敏感,细胞死亡减少;而在肺癌中,抑制其表达则增加NSC670550诱导的细胞死亡,显示了miRNA作用的复杂性。因此,关于miRNA作用,特别是其对化疗的影响仍然需要进一步研究。
表2 可能导致肿瘤化疗耐受的miRNA
肿瘤细胞 | miRNA | 化疗药物 | miRNA靶基因 | 参考文献 |
肺癌 | Let-7i | NSC670550 |
| (Blower et al., 2008) |
| miR-21 | NSC621888, NSC622700, NSC670550, NSC122750 |
| (Blower et al., 2008)
|
卵巢癌 | miR-214 | Cisplatin | PTEN | (Yang et al., 2006) |
乳腺癌 | miR-221, miR-222 | Tamoxifen | ER-α | (Zhao et al., 2008) |
| miR-21 | Topotecan | PTEN | (Meng et al., 2006) |
| miR-221 | Tamoxifen | P27 | (Miller et al., 2008) |
神经母细胞瘤 | miR-17-5p | Doxycline | p21, BIM | (Fontana et al., 2008) |
胆管细胞癌 | miR-21,miR-200b | Gemcitabine | PTEN | (Meng et al., 2006) |
胆管细胞癌(IL6高表达) | Let-7a | Gemcitabine, 5-FU, Campothecin |
| (Meng et al., 2006) |
恶性胶质瘤 | miR-21 | NSC670550, NSC122750 |
| (Blower et al., 2008) |
伯基特氏淋巴瘤 | miR-34a | Bortezomib | c-Myc | (Sotillo et al., 2011) |
白血病 | miR-21 | Arabinosylcytosine | PDCD4 | (Li et al., 2010) |
胰腺癌 | miR-21 | 5-FU |
| (H wang et al., 2010) |
多发性骨髓瘤 | miR-15a/16-1 | Adriamycin,melphalan | FGFR1, PI3KCa, MDM4, VEGFa | (Gatt et al., 2010)
|
头颈部鳞癌 | miR-98 | Cislatin, doxorubicine | HMGA2 | (Hebert et al., 2007) |
肝癌
| Let-7a | Doxorubicine, paclitaxel, IF-γ | RAS, HMGA2 | (Tsang & Kwok, 2008)
|
| miR-188b | Doxorubicine | metalloprotease 3 | (Wang et al., 2009) |
编辑: helen