Label free蛋白质组学非标记定量
· 蛋白质组学非标记定量分析的背景
随着蛋白质组学研究的不断深入 ,对于复杂生命现象的研究必然要求蛋白质组学能够揭示蛋白质的动态变化。这其中就包括了蛋白质在不同状态、环境和处理等情况下表达量的变化,而质谱技术的飞速发展为定量蛋白质组学的研究提供了技术保障。
我们运用由GE公司开发的DeCyder MSTM商业化软件,采用基于图像方式简化大量LC-MS数据分析,并对肽和蛋白质进行相对定量。实验证明此技术具有很好的定量准确性和可信性。
· 蛋白质组学非标记定量分析的特点
1、对液相色谱串联质谱的稳定性和重复性要求较高
2、无需昂贵的同位素标签做内部标准,实验耗费低
3、对样本的操作也最少,从而使其最接近原始状 态,并且不受样品条件的限制,克服了标记定量技术在对多个样本进行定量方面的缺陷。
· DeCyder MSTM软件非标记定量分析的原理
DeCyder MSTM软件对液相色谱串联质谱数据非标记定量分析是将质谱数据由谱峰形式转化为直观的类似双向凝胶的图谱,谱图上每一个点代表一个肽段;再比较不同的样本相应肽段的强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。
DeCyder MSTM软件进行非标记定量分析的过程和原理
编辑: helen