DIGE荧光差异凝胶电泳
Ettan DIGE荧光差异蛋白表达分析系统在传统双向电泳技术的基础上,结合了多重荧光分析的方法,在同一块胶上共同分离多个分别由不同荧光标记(Cy2,Cy3,Cy5)的样品,并第一次引入了内标的概念,极大地提高了结果的准确性,可靠性和重复性。在DIGE技术中,每个蛋白点都有它自己的内标,并且软件全自动根据每个蛋白点的内标对其表达量进行校准,保证所检测到的蛋白丰度变化是真实的。DIGE技术可检测到样品间小于10%的蛋白表达差异,统计学可信度达到95%以上。利用Ettan DIGE技术还可以对微量(少到5μg)样本进行蛋白质组学分析。
原理:
DIGE的工作流程如下:
优点:
1、相对于2D,在检测大量样品时,由于不同样品可以跑同一块胶,大大减轻了工作量。
2、检测灵敏度更高 Detection Limit = 125 pg protein,大大节约了样品,特别是不易得到的珍贵样品。
3、检测动态范围更大-Dynamic range 104 -105,
4、内标归一化 -- 采用内标而消除了胶与胶之间的差异造成的误差
5、统计学分析-- 利用DeCyder软件可以得到统计学可信的结果,极大降低操作者之间的偏差,并且将手工操作时间减少到几分钟。
仪器:
1st dimension:
IEF: IPG-PhorII (GE)
2nd dimension:
GE Ettan DALTsix (26x20cm)
Data acquisition:
GE Typhoon 9400 Scanner
Analysis software:
GE DeCyder for DIGE gels
编辑: helen