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提高PCR反应的灵敏度的方法

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发布日期:2011-11-28 18:09 文章来源:杭州朗基
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关键词: 丁香园 生物专题 杭州朗基 灵敏度 PCR反应   点击次数:

PCR反应的灵敏度是指每个PCR反应管能检测到的最低靶分子数CFU或每微升反应液能检测到的靶分子浓度ng/ul。理论上,每个PCR反应管最低可检测出单个拷贝的靶基因,但受到提取的DNA模板的PCR反应干扰物质的影响、核酸染料的灵敏度的影响等因素,实际能检测到扩增产物所需的靶分子数往往较高。

提高PCR反应的灵敏度的方法:

1. 向反应混合物中添加低浓度的dimethyl sulphoxide(二甲基亚砜),可以扩增出原来不能扩增的靶DNA或允许更长的靶DNA更有效的扩增。

2. 添加20%的甘油能扩增长度达2500bp的靶DNA。

3. 通过热启动Hot Start方法提高反应的特异性,降低同靶DNA竞争的非特异性产物的产生,从而提高灵敏度。

PCR反应物靶基因拷贝数的计算:

对于单拷贝的基因,拷贝数=加入反应管中的细胞数/细菌数;

能够容易分开的的细菌数目可通过血球计数板在显微镜下计数;

具有荚膜或黏液,相互间不能分开的细菌,可通过梯度系列稀释、涂布于培养平版,经培养后计数生长出的菌落数而换算出来。

对于多拷贝的基因,拷贝数=加入反应管中的细胞数(细菌数)×单细胞(单细菌)基因组含有的基因拷贝数;

编辑: cq

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