环境微生物群落多样性分析
3. 单样品微生物种类及丰度分析
1) 序列聚类OTU（Operational Taxonomic Units）
2) 取样深度判定（Rarefaction Curve）
3) 计算菌群多样性和丰度指数
4) 单样品群落结构分析-饼图
4. 多样品间比较分析
1) 全样品相似度比对--树状图、2) Heatmap图
3) 多样品OTU比较--Venn图
4) 多样品群落结构分析--柱状图
5) PCA（Principal component analysis）分析
6) Weighted unifrac PCA分析
7) 组间显著性差异分析
成功案例
美吉生物已成功完成环境微生物群落多样性分析近100例，涉及土壤、水样（海洋、湖泊、鱼塘）、污泥、发酵罐、生物膜、叶子表面、肠道、瘤胃、口腔等多种环境样品。
实验周期
由于合作伙伴的个性化需求不同，实验的周期也各不相同。美吉生物从获得合作伙伴样品、高通量测序到数据分析，一般控制在30到40个工作日内完成。
送样要求
1. 环境样品
1) 严格按照采样标准采样。
2) 采样后务必立即封存样品冷冻保存。
3) 样品保存期间切忌反复冻融。
4) 送样时使用干冰运输。
5) 请填写完整的送样订单，用自封袋密封后随同样品一起送样。
2. 环境样品DNA
1) 请提供OD值介于1.8～2.0之间，浓度＞10ng/μl，总量＞200ng的DNA，并确保DNA无降解。
2) 送样管务必标清样品编号，管口使用Parafilm膜密封。
3) 样品保存期间切忌反复冻融。
4) 送样时使用干冰运输。
5) 请填写完整的送样订单和DNA电泳检测照片，用自封袋密封后随同样品一起送样。
3. PCR产物
1) 请按照美吉生物提供的引物设计要求进行PCR实验。
2) PCR产物浓度＞10ng/μl，总量＞200ng，OD260/280在1.8左右。
3) PCR产物需经电泳切胶回收纯化。
4) 送样管务必标清样品编号，管口使用Parafilm膜密封。
5) 样品保存期间切忌反复冻融。
6) 送样时使用干冰运输。
7) 请填写完整的送样订单，并提供PCR产物纯化前后的电泳检测照片，用自封袋密封后随同样品一起送样。
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编辑: helen
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